Позитивный антоним: Страница не найдена 404

Содержание

Что такое позитивный : значение слова, синонимы, антонимы

Значение слова «позитивный» описывается в нескольких толковых словарях русского языка. Все они согласны в одном: оно несет положительный смысл. Слово «позитивный» имеет много синонимов, у которых такой же положительный характер.

Что такое позитивный?

Согласно толковому словарю автора Д. Н. Ушакова, слово «позитивный» («позитивная», «позитивна», «позитивен») произошло от латинского слова positivus, что означает «положительный». Значение противоположное ему — «негативный».

В ответ на вопрос: «Что такое «позитивный»?», Ефремова Т. Ф. в своем словаре указывает на соотношение слова в прилагательной форме со словом существительным «позитив». Им характеризуется предмет, ситуация или человек, как заслуживший похвалы, приносящий пользу, опытный.

Шведова Н. Ю. и Ожегов С. И. в своем толковом словаре поясняют, что такое «позитивный». Позитивная, позитивное, позитивна, позитивен напрямую связаны с позитивом, основанным на фактах и опыте. Знания о позитиве. Имеет то же значение, что и слово «положительный». Как существительное употребляется «позитивность».

Употребление слова в русском языке

Синонимы слова «позитивный»:

  • хороший;
  • положительный;
  • похвальный;
  • конкретный;
  • благоприятный;
  • утвердительный.

Антонимы к слову «позитивный»:

  • негативный;
  • отрицательный;
  • неодобрительный;
  • плохой.

Слово » позитивный» употребляется вместе со словами:

  • динамика, мотивация, изменения, аспект, направленность, тенденция, аналитика, ситуация, объект, поведение человека;
  • реализация, выявление, превалирование, соотношение, характеристика;
  • обусловленный, влияющий, проявляющийся, определяющий, ориентированный.

Слово «позитивный» склоняется по падежам в единственном и множественном числе, применяется к женскому и мужскому роду.

Что такое позитивный? Это слово, которое всегда будет употребляться в русском языке исключительно в положительных ситуациях, описывая хороших людей и их поступки.

Что антоним одиночества? — Самотрансформация — ЖЖ

Что такое одиночество?

Многие люди страдают от этого слова, кто-то считает себя одиноким, так как у него нет друзей, семьи. А у кого-то это есть, но он всё-равно может назвать себя одиноким.
Литвак в своей книге «Принцип сперматозоида» пишет «одиночество для человека, это как море для кита, а общение — как вдох воздуха», и когда я приняла для себя эту фразу, то поняла, что вопроса одиночества для меня не стоит, но сегодня он возник по другим причинам.

В слово одиночество можно включить разные чувства, это и одиночество физическое, когда в принципе никого нет вокруг, тогда цитата выше — самая подходящая. Но также это одиночество психологическое, когда человек начинает считать, что рядом нет человека который бы его понял, другой вариант, это когда нету никого кто мог бы поддержать, и наконец никого, кто мог бы помочь.

Вы когда-нибудь встречали на пути людей которые говорили: «Я совсем один. .. я один тяну семью… один… один». Но на проверку, если такой человек поговорит с психологом, то может обнаружится, что человеку то и не нужно «тянуть», всегда в его жизни были люди, которые бы хотели помочь, а он отказывался. Ну и естественно этот человек никогда никого и не просил о помощи, вот и получилось, что он один «тянет» (А может еще он этому и гордится?)

Так всё же что такое одиночество? Но даже не это меня больше интересует, а то, каким может быть антоним одиночеству.
Но тут появляется проблема, нельзя найти антоним одиночеству, как на пример к плохо будет хорошо, или грязный и чистый.
Потому что «одиночество» многоранно, а вот антонимы к нему однобоки.
Например одиночество социальное, когда «никому не нужен» — антоним будет чувство востребованности;
А одиночество физическое с каким-либо человеком, другими словами «разлука» — антонимом будет чувство близости;
Одиночество в плане «беспомощность» — антоним будет чувство покровительсвта или чувство помощи.
Ну и наконец одиночество в плане отсутствия понимающих тебя людей — чувство дружбы (в контексте общего языка и общих интересов).

С развитием психологии и трансляции её в массы, вы наверное уже в курсе, что человек существо программируемое, как в позитивную(положительные эмоции), так и негативную сторону(отрицательные эмоции). И если вы проследите за своей мозговой деятельностью в течении хотя бы дня, то наверняка заметите, что какие-то мысли повторяются у вас чаще, а какие-то реже.
А если проведете над собой такой эксперимент в течение недели, то заметите, что ваша «словомешалка» повторяет одинаковые паттерны, которые напрямую влияют на то, как вы поступаете в своей жизни.

Отловите парочку таких паттернов про одиночество и замените из на позитивный антоним, и ищите подтверждение ему.
Ваш мозг будет мягко говоря в шоке, и будет стараться вас разубедить, так как «новая дорога» дня него непонятная и сложная (это ведь новые нейроны надо создавать 🙂 ), но настаивайте на своём и это станет первым шагом к переменам в жизни.

Попробуйте! 🙂

Оливер Буркеман «Антидот. Противоядие от несчастливой жизни» — отзыв от Arahobit

В целом неплохая книга. Ничего особо оригинального, но читается с интересом. Кстати, почему «Антидот»? Своеобразный неологизм, в понимании Буркемана антоним к слову «позитивный».
Отмечу некоторые допущенные автором неточности. Во-первых, стоики никогда не считали, что все без исключения обстоятельства человеческой жизни не контролируются человеком. Есть обстоятельства жизни, которые мы можем контролировать, есть обстоятельства жизни, которые мы можем контролировать, но частично и конечно же существуют обстоятельства жизни, которые мы не контролируем (дихотомия контроля). К последним относятся неизбежность болезней, старости, смерти, перемен и.т. п.

Для каждого случая своя стратегия. Мне очень нравится стоическая этика за мужество, рациональность и прагматизм. Не имеет значения кто нам ближе, Аврелий, Сенека, Эпиктет, Зенон. .. Столики всегда делали акцент на том, что при встрече с самыми тяжёлыми и трагическими обстоятельствами жизни, человек в силах справится с ними. Например, если человек не может изменить обстоятельства своей жизни, он может изменить свое отношение к событиям жизни. Стоики говорили: не само событие, а мое суждение, оценка события расстраивает меня. Любое событие в жизни человека имеет нейтральный характер. Оно становится хорошим или плохим, добрым или злым только после того как наше сознание оценивает это событие. Современная когнитивная психотерапия исходит из тех же предпосылок: причины психологических проблем человека кроются в ошибках мышления. Цель терапии — изменить нелогичные или иррациональные мысли, убеждения человека, которые делают человека несчастным. Кстати, в книге есть забавная история об основателе когнитивной терапии Альберте Эллисе. Хотя до сих пор отцовство оспаривается: Бек или Эллис, а может Келли? В общем Эллис дядька замечательный, интересный, умный, но скажем своеобразный человек, не без странностей.
Не удивительно, что согласно опросу проведенному среди американских психологов, самыми выдающимися психологами современности признаются К. Роджерс затем идет А. Эллис и только на третьем месте З. Фрейд.
Во-вторых, буддизм. Конечно, интересно было познакомится с опытом автора прохождения ретрита в медитационном центре, но, буддизм — это не только созерцательная медитация о чем постоянно талдычит автор. Буддийская традиция имеет огромный опыт аналитической медитации. Буддизм — это не только однонаправленность внимания и успокоение ума. Аналитическая медитация включает проверку учения, повседневных проблем с целью определения, логичны ли они, описывают ли они наш опыт реалистично, чем наш обычный образ мышления. Приведу рассуждения Далай-Ламы о причинно-зависимом происхождении: «Некоторые буддийские школы, например, Вайбхашика, полагают, что континууму «я» можно положить конец. Однако в большинстве традиций считается, что у него нет ни начала, ни конца, поскольку континуум «я» связан с потоком сознания, а, согласно общим воззрениям буддийских школ, у сознания нет начала.
Если же мы станем утверждать, что у сознания есть начало, то нам придется согласиться с тем фактом, что первый момент осознавания возник без причины и из ниоткуда. Это будет противоречить основополагающим принципам буддизма, то есть закону причинно-следственной связи. Буддизм говорит о взаимозависимой природе действительности: любое явление возникает вследствие соединения определенных причин и условий. И если допустить, что сознание возникает без причины, то подобное утверждение вступит в противоречие с этим базовым принципом.» Глупо было бы утверждать, что по причине многочасового созерцания подъема и опускания стенки собственного живота, далай-лама пришел к такому рациональному выводу.
Книга представляет собой небольшой сборник рекомендаций (почерпнутых автором из философских идей и жизненных историй) как человеку примириться с неизбежностью страданий, жизненной неопределенностью и даже научиться ценить смерть. В последнем нет ничего удивительного. Чем чаще мы помним о смерти, тем сильнее ценим жизнь. Эти слова не фокусы современного постмодернизма, а здравый смысл, которого все меньше становится в мире. Кстати, мне понравилось описание Буркеманом праздника мертвых в Мексике. Вы задумывались, почему русские на кладбище плачут, а мексиканцы смеются? Первое , что приходит в голову, разная культура. Да, разная культура и разное отношение к смерти, на мой взгляд у мексиканцев более мудрое, ироничное и зрелое.
Прочитав эту книгу, каждый сможет побыть немного стоиком, немного буддистом или возможно, стать прагматичным человеком.
Вы когда-нибудь задумывались о том почему любовь, семья, материальный достаток часто становятся источником стресса, а не благополучия. Почему например, оптимистическое отношение к жизни, достижение поставленных целей, получение желаемого, не делает нас счастливыми и благополучными? Вернемся к теме книги. У А. Пушкина есть фраза «Нет зла без добра» , именно в этой форме употребил ее Пушкин в «Истории Пугачевского бунта», рассуждая о том, что бунт ускорил проведение необходимых административных преобразований. Точно также наши разочарования, трудности, серьезные проблемы имеют свою обратную сторону — возможности для личностного роста и саморазвития. Человек с синдромом «дна» — это нормально. Будда прямо сказал: жизнь — это страдание. Да, жизнь — это страдание. Но в жизни часто страдание становится катализатором роста и развития и нам следует учится принимать боль жизни и учится работать с ней. Боль все расставляет по своим местам, она избавляет от подростковых иллюзий ( привет, добро пожаловать во взрослую жизнь) и не дает перестать думать. Боль — источник исчезновения одних вещей и появления других, боль толкает нас к действию или бездействию, заставляет искать решения или опустить руки. Боль вынуждает двигаться или сдаться, сближаться или расставаться, изменяться в мыслях, поведении, образе жизни, делать зрелые выводы, выбирать оптимальный ритм существования или принять все как есть. Боль формирует новую систему ценностей и установок поведения, заставляет нас делать сознательный и обдуманный выбор.
Принимая неизбежные и тяжелые стороны жизни как неотъемлемую часть самой жизни, вырабатывая правильные навыки совладания с ними, мы становимся более спокойными, мужественными, вырабатываем собственный философский взгляд на жизнь и… это может показаться странным, чувствуем себя более благополучно и свободно. Книга дает точек к «заплыву на дальние дистанции».

Список важных антонимов на английском языке (прилагательные)

Полезно знать

Антонимы – слова, имеющие противоположные значения. Как правило, относятся к одной части речи и образуют пары. Знание таких пар слов на английском языке позволит вам легко увеличить словарный запас, поможет строить новые предложения, вы сможете легче ориентироваться в языке. Мы подготовили список самых распространенных прилагательных, учите и начинайте использовать.

empty – full

пустой – полный

hard – easy

трудный – легкий

quick – slow

быстрый – медленный

clever – stupid

умный – глупый

correct – wrong

правильный – неправильный

deepshallow

глубокий – мелкий

dry – wet

сухой – мокрый

frequent – rare

частый – редкий

firstlast

первый – последний

funny – serious

смешной – серьезный

busy – free

занятый – свободный

youngold

молодой – старый

quiet – noisy

тихий – шумный

cold – hot

холодный – горячий

earlylate

ранний – поздний

dead – alive

мертвый – живой

front – back

передний – задний

bigsmall

большой – маленький

bright – dim

яркий – тусклый

clean – dirty

чистый – грязный

terriblegreat

ужасный – отличный

cruel – kind

жестокий – добрый

dangerous – safe

опасный – безопасный

beautiful ugly

красивый – безобразный

cheerful – gloomy

радостный – мрачный

positive – negative

позитивный – негативный

previousnext

предыдущий – следующий

possible – impossible

возможный – невозможный

rich – poor

богатый – бедный

right

left

правый – левый

simple – complex

простой – сложный

strange – normal

странный – обычный

sweet – salty

сладкий –соленый

tall – short

высокий – низкий

fat – thin

толстый – тонкий

truefalse

верный – ложный

near – Far

близкий — далекий

new – Old

новый — старый

goodBad

плохой — хороший

hardEasy

простой – сложный

Приходите на курсы английского языка в языковой центр DIY!

30 марта, 2014, 40501 просмотр.

Методы запоминания иностранных слов: методы оптимизации

Продолжаем рубрику знакомства с методами запоминания иностранных слов. На этот раз предлагаем метод оптимизации. Упражнения и рекомендации достаточно просты для понимания и дают быстрый позитивный эффект.

Метод группировки по грамматическим признакам

Основано на том, что вы начинаете видеть логику языка и запоминать слова в связке с им подобными. Для этого нужно сгруппировать свои слова по тому, к какой части речи они относятся. При этом старайтесь выписывать в словарик не подряд, а по дополнительному общему признаку. Например, по окончаниям — treasure, measure, pleasure, или по второй и третьей форме глагола — catch-caught-caught, teah-taught, taught. То есть, все слова приводите в некую систему, включая исключения.

 

Метод группировки по смыслу

Метод помогает значительно обогатить свой словарный запас. Для этого запоминаем не только нужное слово, а дополняем противоположным по смыслу и похожим по смыслу словами. Например, узнали слово «small», добавьте антоним big и синоним little, а можно пойти дальше и запомнить huge-огромный и teeny-крохотный. Тогда, вспомнив хотя бы одно слово из этого ряда, можно будет выйти из ситуации, даже если нужное small и не вспомнится.

 

Метод изучения однокоренных слов

Мы берем слова, группируем их вокруг корня, например, «дело/сделать/сделанный», и выучиваем сразу несколько однокоренных частей речи. В «Мистер Смарт» особенно часто этим методом мы пользуемся при подготовке к ОГЭ и ЕГЭ, где есть специальное задание на словообразование. Так, например, студенты запоминают слова, связанные с наукой — science, scientist, scientific. Здесь дополнительный помощник — ваши знания по окончаниям и суффиксам. 

 

Метод «Полстранички»

Лист сгибаем напополам: на одной стороне листа пишем слово, а на другой – перевод. Страницу переворачиваем только в том случае, если не помним значения слова. Можно использовать тетрадь-словарик: закрываем вторую часть чем-нибудь непрозрачным и восстанавливаем. Когда уже будет получаться переводить с английского на русский, то можно тренироваться наоборот, закрыв первую часть и вспоминая английские слова.

 

Этимологический метод

Этот метод — находка для полиглотов, любимый метод наших преподавателей. Когда знаешь несколько языков и изучаешь язык из той же «семьи», начинаешь видеть похожие корни. Некоторые слова похожи по написанию и по произношению. Например, слово friend (англ.) и Freund (нем.) Таким образом, с опытом пропадает необходимость еще раз выучивать огромное количество слов.

 

Цепочки слов

Берем список слов, которые нужно выучить, и составляем из них некую историю (пусть даже бредовую). Так, например, можно выучить не 30 слов, а 5 предложений по 6 слов в каждом. Причем, если у вас еще уровень языка низкий, историю можно составить на своем родном языке, включая английские слова из списка.

Кто такие лояльные клиенты и какую пользу они приносят бизнесу

Лояльность — это верность бренду, компании, магазину или предприятию (от англ. «loyalty»). В широком смысле — неравнодушное позитивное отношение, которое имеет рациональное и эмоциональное начало.

Эмоциональная сторона лояльности основывается на том, что клиенту близки ценности компании, её позиционирование на рынке, рекламные образы и посылы. А рациональная — на удовлетворённости качеством товаров и услуг и выгоде, которую получает клиент от долгосрочного и регулярного сотрудничества с брендом. Без эмоциональной вовлечённости потребитель не станет по-настоящему лояльным, так как его ничто не удержит, если цены слегка вырастут, а качество сервиса — упадёт.

Преданный покупатель реже смотрит по сторонам в поиске более выгодных условий и не так чувствителен к несовершенствам продукта. И более того, он приносит компании пользу не только в денежном эквиваленте.

Лояльный и постоянный клиент — не одно и то же. Постоянный совершает покупки часто, но необязательно предан компании. А лояльный клиент может покупать реже, но при этом важнее для бренда, потому что он:

Средний чек лояльного клиента выше, чем обычного: даже если цены вырастут, он не уйдёт к конкурентам, потому что привязан к бренду и любит продукт, ассоциирует себя с ним.

Лояльная аудитория — неиссякаемый источник «сарафанного радио», бесплатной рекламы. Потенциальный клиент, услышав от лояльного живой, лестный отзыв о бренде, с большой вероятностью отдаст предпочтение именно рекомендованной компании даже при наличии конкурентов.

Увидев негативный отзыв, лояльный клиент по собственному желанию бросится защищать бренд и поделится личным позитивным опытом.

Если компании понадобится протестировать новый сервис или опробовать пилотную версию продукта, лояльный клиент будет рад сделать это в первых рядах и с готовностью даст обратную связь.

Когда клиент сталкивается с услугами или товарами компании, его поведение зависит от этапа взаимоотношений с брендом.

Разовый покупатель совершает покупку случайно. Он может кликнуть по ссылке на сайт в блоке контекстной рекламы или заглянуть в магазин, который попался по пути. Это его первая покупка. Если впечатление о ней будет сильным и позитивным, разовый покупатель, возможно, запомнит понравившуюся компанию, но гарантий этого нет.

Просто покупатель знаком с компанией и её ассортиментом. Он выбирает компанию потому, что ему так удобно: покупатель уже знает, что у вас есть то, что ему нужно.

Постоянный покупатель — тот, кто доволен сочетанием цены и качества. И остаётся с компанией до тех пор, пока не найдёт более выгодное предложение.

Лояльный покупатель не просто выбирает продукцию компании, но испытывает симпатию к бренду, разделяет его ценности. И терпимо относится к ошибкам, пока чувствует себя значимым.

Приверженец бренда соотносит себя с имиджем бренда и делает выбор на основе характеристик, которые ему нравятся: «для настоящих мужчин», «только для успешных людей», т.п.

Фанатичный приверженец бренда — редкая категория клиентов, которые есть только у некоторых компаний. Фанатики слепо поклоняются компании и своим обожанием влияют на формирование её имиджа.

Последние 3 типа клиентов считаются самыми предпочтительными для компаний, с учётом того, что фанатичные приверженцы брендов встречаются нечасто и не в каждой сфере. Задача бизнеса — увеличивать количество лояльных клиентов и приверженцев бренда, чтобы за их счёт сформировать солидную «подушку безопасности» и развиваться дальше.

Вот несколько советов, которые помогут вызвать у клиента желание возвращаться к вам за услугами и товарами.

Через несколько лет после покупки клиент может и забыть, что именно и за сколько он у вас купил, но никогда не забудет, что с ним плохо обошлись. И ещё обязательно расскажет об этом своему окружению. Любая компания с качественными товарами и широким ассортиментом будет для потребителя хорошей до тех пор, пока не испортит о себе впечатление ужасным сервисом.

Авторы книги «Всегда ваш клиент» Мэттью Диксон, Ник Томан и Рик Делиси не верят в сервис и советуют работать с потребителем так, чтобы у него в принципе не возникало проблем при взаимодействии с компанией — иначе говоря, чтобы им вообще не приходилось общаться с сервисным отделом или техподдержкой. Это возможно только при наличии превосходного продукта, который понятен и привлекателен для клиента сам по себе. Авторы рекомендуют делать ставку не на то, чтобы превзойти ожидания клиента (это дорогое удовольствие), а на то, чтобы их в полной мере оправдать — при помощи качества услуги или продукции. И это отличный совет для начинающего бизнеса.

Изучите свою аудиторию и спросите уже лояльных клиентов, почему они выбирают вас. Соотнесите данные с ценностями компании и выберите эффективные способы транслировать их клиентам: напечатать на упаковке, озвучить в рекламе в соцсетях, придумать выразительный слоган и т.п. Без чётко сформулированных, близких аудитории ценностей не получится сделать потребителя эмоционально лояльным.

Имея дело даже с самым неадекватным клиентом, вы должны «перекрыть» ответной репликой или действием его негативный опыт. Такая тактика гораздо лучше игнорирования проблемы, ведь по реакции на ситуацию о вас будут судить другие клиенты — те, кто узнал о случившемся из первых уст, отзыва на сайте или в соцсети. Если компания действительно не права, извинитесь и предложите компенсацию. Если не прав клиент, деликатно объясните суть проблемы и оставьте покупателя с ощущением, что, несмотря на неправоту, его услышали.

Придумайте несколько способов стимулировать повторные продажи и вызвать у клиентов привязанность к бренду. И на основе этих идей разработайте программу лояльности, которая поможет пополнить ряды преданных покупателей. Подробнее о том, как это сделать, читайте в статье «Как разработать программу лояльности».

148 Синонимов и антонимов ПОЛОЖИТЕЛЬНЫЙ

1 выражение одобрения
  • надеялся на положительную реакцию публики
  • неблагоприятный,
  • амортизационная,
  • амортизационная,
  • уничижительный,
  • неодобрительно,
  • неблагодарный,
  • отрицательный,
  • неблагодарный,
  • нелестный,
  • неблагоприятный,
  • нелестно,
  • недружественный
2 иметь или показывать разум, свободный от сомнений
  • Я уверен что это правильное направление
3 не способный быть оспоренным или доказанным неправым
  • ищет положительное доказательство существования НЛО
  • выполнено,
  • наверняка,
  • бесспорно,
  • неоспоримый,
  • неопровержимый,
  • неоспоримый,
  • несомненно,
  • неразрушимый,
  • неопровержимый,
  • конечно,
  • без ответа,
  • бесспорно,
  • неоспоримый,
  • бесспорно,
  • несомненно
  • Ответственный,
  • спорный,
  • противоречивый,
  • спорный,
  • спорный,
  • спорный,
  • сомнительно,
  • спорный,
  • договорная,
  • проблемный
  • (тоже проблематично),
  • сомнительный,
  • опровержимый
См. определение в словаре

Антоним положительного

  • положительного, положительного степенисуществительного

    основная форма прилагательного или наречия; обозначает качество без квалификации, сравнения или отношения к увеличению или уменьшению

    Антонимы:
    нейтрализованный, застенчивый, грамотрицательный, встречный, неопределенный, отрицательный, неуверенный, нейтральный, незрячий, незаряженный, робкий, неуверенный, отрицательный, отрицательный антагонистический, опровергающий, застенчивый, неформальный, извращенный, нейтрализованный, невыгодный

    Синонимы:
    положительная степень

  • положительное прилагательное

    фильм, показывающий фотографическое изображение, антонимы которого соответствуют тонам исходного субъекта
    извращенный, неформальный, невыгодный, неуверенный, незрячий, робкий, отрицательный, нейтральный, неуверенный, неуверенный, опровергающий, грамотрицательный, отрицательный, антагонистический, нейтрализованный, застенчивый, нейтрализованный, отрицающий, застенчивый, встречный, незаряженный

    Синонимы:
    положительная степень

  • положительная прилагательная

    характеризующаяся или отображающая утверждение или принятие или уверенность и т. д.

    «положительный настрой»; ‘все отзывы положительные’; «положительная выгода»; «положительный запрос»

    Антонимы:
    нейтрализованный, грамотрицательный, неуверенный, нейтральный, минус, незаряженный, встречный, неуверенный, опровергающий, нейтрализованный, неуверенный, отрицательный, невыгодный, застенчивый, извращенный, антагонистический, отрицательный, робкий, неформальный, застенчивый, незрячий

    Синонимы:
    самоуверенный, неопровержимый, предписанный, позитивистский, самонадеянный, электроположительный, положительно заряженный, неопровержимый, убежденный(р), плюс, позитивный(р), подтверждающий, уверенный(р), позитивистский

  • убежденный(р), положительный(р), уверенный(р) прилагательное

    убежденный в; очень уверены, что

    «были убеждены, что им будет выгодно присоединиться»; «Я уверен, что он лжет»; «был уверен, что выиграет»

    Антонимы:
    неуверенный, незрячий, минус, нейтрализованный, извращенный, нейтральный, незаряженный, отрицательный, неуверенный, грамотрицательный, антагонистический, застенчивый, опровергающий, неуверенный, робкий, застенчивый, отрицательный, неформальный, встречный, нейтрализованный, невыгодный

  • плюс, положительныйприлагательное

    включающий преимущество или благо

    «плюс (или положительный) фактор»

    Антонимы:
    нейтрализованный, отрицательный, неуверенный, минус, встречный, отрицательный, неподтвержденный, застенчивый, нейтральный, невыгодный, нейтрализованный, неуверенный, застенчивый, незрячий, антагонистический, незаряженный, грамотрицательный, неуверенный, робкий, неформальный, извращенный

    Синонимы:
    самоуверенный, предписанный, позитивист, самоуверенный, электроположительный, положительно заряженный , неопровержимый, убежденный (р), позитивистский, плюс, положительный (р), подтверждающий, уверенный (р), неопровержимый

  • положительный, подтверждающий прилагательное

    9010 9, указывающий на существование или присутствие подозреваемого состояния или возбудителя

    «положительный тест на беременность»

    Противопоставления:
    Грамотрицательный, извращенный, неопределенный, незаряженный, нейтрализованный, неопределенный, встречный, невыгодный, неуверенный, отрицательный, нейтрализованный, отрицательный, застенчивый, нейтральный, антагонистический, робкий, неформальный, застенчивый, минус, незрячий, опровергающий

    Синонимы:
    неопровержимый, подтверждающий, уверенный(р), положительно заряженный, содержательный, положительный(п), подтверждающий, подтверждающий, электроположительный , побочный, неопровержимый, подтверждающий, подтверждающий, обосновывающий, позитивистский, подтверждающий, плюс, убежденный (p), подтверждающий, предписанный, позитивистский, подтверждающий, самоуверенный, самонадеянный, подтверждающий

    «позитивные законы»

    Антонимы:
    неуверенный, минус, неуверенный, застенчивый, отрицательный, незаряженный, счетчик, neu трализованный, робкий, извращенный, неуверенный, нейтрализованный, грамотрицательный, незрячий, застенчивый, невыгодный, отрицательный, неформальный, нейтральный, опровергающий, антагонистический

    Синонимы:
    неопровержимый, декретированный, подтверждающий, уверенный(р), официальный, положительно заряженный, позитивный(р), электроположительный, неопровержимый, позитивистский, предписанный, плюс, убежденный(р), предписанный, назначенный, позитивистский, самоуверенный, самоуверенный

  • неопровержимый, неопровержимый, положительныйприлагательное

    невозможно отрицать или опровергать

    » неопровержимые доказательства невиновности подсудимого»; «доказательство положительное»; «неопровержимый аргумент»

    Антонимы:
    Грамотрицательный, встречный, отрицательный, отрицательный, неуверенный, застенчивый, неуверенный, незрячий, неформальный, незаряженный, антагонистический, нейтральный, опровергающий, нейтрализованный, извращенный, нейтрализованный, невыгодный, неуверенный, минус, робкий, застенчивый

    Синонимы:
    самоуверенный, доказуемый, позитивистский, самоуверенный, электроположительный, предписанный, положительно заряженный, неопровержимый, убежденный(р), позитивистский, плюс, позитивный(р), подтверждающий, уверенный(р), неопровержимый

  • позитивист, позитивист, позитивист прилагательное

    относящееся к позитивизму

    «позитивистские мыслители»; «позитивистское учение»; «позитивная философия»

    Антонимы:
    извращенный, нейтрализованный, отрицательный, отрицательный, неформальный, неуверенный, неуверенный, отрицательный, застенчивый, неуверенный, грамотрицательный, незрячий, антагонистический, незаряженный, нейтральный, робкий, нейтрализованный, опровергающий, невыгодный , застенчивый, встречный

    Синонимы:
    самоуверенный, предписанный, позитивистский, самоуверенный, электроположительный, положительно заряженный, неопровержимый, убежденный(р), неопровержимый, плюс, позитивный(р), подтверждающий, уверенный(р), позитивистский

  • положительное прилагательное

    считается, расположено или имеет тенденцию в направлении, которое естественно или произвольно принимается для обозначения роста, прогресса или движения вперед , отрицательный, неуверенный, отрицательный, незаряженный, неформальный, робкий, встречный, неуверенный, опровергающий, застенчивый, неуверенный, грамотрицательный, незрячий, нейтрализующий ed, извращенный, застенчивый, невыгодный

    Синонимы:
    самоуверенный, неопровержимый, предписанный, позитивистский, самоуверенный, электроположительный, положительно заряженный, неопровержимый, убежденный(р), плюс, положительный(р), подтверждающий, уверенный(р), позитивистский

  • положительныйприлагательное

    больше нуля

    «положительные числа»

    Антонимы:
    антагонистический, извращенный, опровергающий, невыгодный, отрицательный, неуверенный, нейтрализованный, грамотрицательный, минус застенчивый, неуверенный, незрячий, нейтральный, неформальный, незаряженный, нейтрализованный, застенчивый, робкий

    Синонимы:
    самоуверенный, неопровержимый, предписанный, позитивистский, самоуверенный, электроположительный, положительно заряженный, неопровержимый, убежденный(р), плюс, позитивный( p), подтверждающий, уверенный(p), позитивистский

  • положительный, электроположительный, положительно заряженный прилагательное

    имеющий положительный заряд протоны положительные минус, невыгодный, нейтральный, робкий

    Синонимы:
    самоуверенный, неопровержимый, предписанный, позитивистский, самоуверенный, электроположительный, положительно заряженный, неопровержимый, убежденный(р), плюс, положительный(р), подтверждающий, уверенный(р), позитивист

  • самоуверенный, самоуверенный, позитивный прилагательное

    отмеченный чрезмерной самоуверенностью

    «высокомерный и самоуверенный материалист»; «настолько самонадеянный и нахальный, что заговорил с королевой»; «чем меньше он знает, тем более позитивным он становится»

    Антонимы:
    неформальный, незаряженный, застенчивый, нейтрализованный, извращенный, нейтральный, неуверенный, неуверенный, отрицательный, невыгодный, неуверенный, нейтрализованный, антагонистический, отрицательный, отрицательный, робкий, незрячий, застенчивый, встречный, опровергающий, грамотрицательный

    Синонимы:
    самоуверенный, предписанный, позитивистский, самоуверенный, электроположительный, положительно заряженный, неопровержимый, убежденный(р), позитивистский, плюс, положительный(р), подтверждающий, уверенный (р), неопровержимый

  • Положительные Синонимы | Английский тезаурус Коллинза

    Определение

    склонность подчеркивать, что хорошо

    позитивный настрой

    Синонимы

    оптимистичный

    Майкл был в веселом и оптимистичном настроении.

      надежда

    Хирурги надеялись сохранить ей зрение.

      оптимистичный (неофициальный)

    Коллеги Нила говорят, что на самом деле он был в шутливом, приподнятом настроении.

      плавучий

    Она была в приподнятом настроении.

      сангвиник

    Он удивительно оптимистичен в отношении связанных с этим проблем.

     

    См. примеры синонимов

    Противоположности

    Определение

    стремление к прогрессу или улучшению

    Работа за границей должна быть положительным опытом.

    Синонимы

    полезные

    витамины, полезные для здоровья

      эффективные

    Антибиотики эффективны против этого микроорганизма.

      полезный

    Полиция получила полезную информацию об организации.

      практичный

    У нас пока нет практического способа предотвратить рак.

      полезно

    Каталог содержит полезную информацию.

      стоит

    Исследование не дало каких-либо стоящих результатов.

      конструктивный

    Оба мужчины охарактеризовали переговоры как откровенные, дружеские и конструктивные.

      прагматичный

    прагматичный подход к проблемам Латинской Америки

      эффективный

    Назальный спрей был новинкой на рынке и обладал высокой эффективностью.

     

    См. примеры синонимов

    Противоположности

    Мирные усилия получили положительный отклик.

    Синонимы

    благоприятный

    Он положительно отозвался о ее работе.

      поддерживающий

    Они всегда поддерживали друг друга.

     

    См. примеры синонимов

    Противоположности

    Определение

    определенно или определенно

    Я уверен, что она сказала, что будет здесь.

    Синонимы

    определенные

    Она абсолютно уверена, что станет певицей.

      конечно

    Она больше не была уверена, что думает о ситуации.

      уверенно

    Я уверен, что все получится вовремя.

      удовлетворен

    Люди должны быть уверены, что лечение безопасно.

      гарантировано

    Наша победа обеспечена; ничто не может остановить нас.

     

    без сомнений  

    См. примеры синонимов

    Противоположности

    Определение

    выражающее уверенность

    Положительных доказательств не было.

    Синонимы

    определенный

    Слишком рано давать однозначный ответ.

      очистить

    Важно четко понимать, о чем здесь говорит автор.

      прямой

    Мы отрицаем прямую связь между этими двумя случаями.

      экспресс

    Меня предупредили, чтобы я не покидал свой пост без специального приказа.

      фактический

    Она написала несколько заметок, но не приступила к реальной работе.

      абсолютное

    Он принес абсолютное доказательство, в котором мы нуждались.

      решающий

    решающая победа на выборах

      явное

    Он оставил подробные инструкции по установке будильника.

      сплошная рубка

    Она одержала явную победу на вчерашних выборах.

      безошибочно

    неповторимый аромат свежемолотого кофе

      убедительный

    Убедительных доказательств того, что убийство имело место, нет.

      однозначно

    Безоговорочное стремление Ричардсона к честной игре

      бесспорно

    Бесспорно, что животные являются носителями этой болезни.

      категориальный

    Он выступил с категорическим опровержением всех обвинений.

      неопровержимо

    неопровержимые доказательства того, что правительство нарушает соглашение

     

    прибитые (сленг)  

    См. примеры синонимов

    Противоположности

    Определение

    полное

    (неформальное)

    Он был в ярости.

    Синонимы

    абсолютный

    Больной человек должен полностью доверять врачу.

      полный

    Он выставил меня полным идиотом.

      совершенный

    Она вела себя как совершенная дура.

      справа (британский, неофициальный)

    Он дал им право отчитываться.

      действительный

    Вы, должно быть, думаете, что я настоящий идиот.

      всего

    Машина была в полном беспорядке.

    Я имею в виду, что я не полный идиот.

      ранг

    Он обвинил своего соперника в высокомерном лицемерии.

      чистота

    актов полнейшего отчаяния

      полных

    На его красивом лице отразилось полное замешательство.

      тщательный

    Я был законченным маленьким академическим снобом.

      непревзойденный

    Он был непревзойденным лжецом и преувеличением.

      истинный

    настоящий праздник развлечений

      безудержный

    Старший офицер полиции назвал его отъявленным лжецом.

     

    См. примеры синонимов

    Определение

    стремление к прогрессу или улучшению

    Он сказал, что соглашение может быть положительным знаком.

    Синонимы

    хороший

    Биотехнология должна стать хорошей новостью для развивающихся стран.

      перспективный

    новый и многообещающий этап переговоров

      обнадеживающий

    Результаты оказались не очень обнадеживающими.

      добро пожаловать

    долгожданное изменение привычной рутины

      благоприятное

    наиболее благоприятный момент для запуска кампании

     

    См. примеры синонимов

    Синонимы

    решили

    человек очень решительных мнений

      сильный

    Он был человеком сильного характера.

      эмфатический

    Его ответ был немедленным и решительным.

      решительный

    решительный и решительный международный лидер

      догматичный

    Его догматический стиль отклоняет оппозицию.

      самоуверенный

    Он самоуверенный человек, который всегда думает, что знает лучше.

      императивное

    Он безапелляционно относился к своим коллегам.

     

    См. примеры синонимов

    Противоположности

    Цитаты

    положительный: ошибся во весь голос. -my-nate отрицательное
    Прикрепитесь к утвердительному
    Не связывайтесь с Мистером Посередине [Johnny Mercer – Accent-tchu-ate the Positive]

    Copyright © 2016 HarperCollins Publishers.Все права защищены.

    Еще одно слово для «позитивного» | Список из 100+ синонимов слова «положительный» с примерами • 7ESL

    Какое другое слово означает «положительный»? В этом уроке представлен список «положительных» синонимов на английском языке с картинками ESL и полезными примерами предложений. Выучите эти слова, чтобы использовать их вместо слова «положительный», чтобы расширить свой словарный запас английского языка.

    Содержание

    • Положительный синоним
      • Положительное определение и примеры
      • Другие слова для «Положительный»
      • Положительные синонимы Инфографика
    • Другое слово для положительного
      • Положительные синонимы с примерами
      • Инфографика

    Положительный синоним

    Положительное определение и примеры

    Значение «Положительно»: 

    Прилагательное : вселяющий уверенность и оптимизм, полный надежды

    • Пример: «Вам нужен более позитивный подход к жизни»

    Существительное : Хорошая и оптимальная ситуация или качество

    • Пример: «Посмотрите на плюсы этой программы, она действительно поможет вам в жизни»

    Другие слова для «положительного»

    Широко используемые синонимы слова «Положительный».

    • Оптимистичный
    • Обнадеживающий
    • Уверенный
    • Перспективный
    • Веселый
    • Сангин
    • Плавучий
    • Гарантия
    • Приподнятый
    • Действующий
    • Полезное
    • Полезно
    • Прогрессивный

    Большой список из более чем 100 разных слов, которые можно использовать вместо слова «положительно».

    • Абсолют
    • Фактический
    • Подтверждаю
    • Приемлемый
    • Обращение
    • Произвольный
    • Напористый
    • Гарантия
    • Благоприятный
    • Выгодный
    • Яркий
    • Плавучий
    • Категориальный
    • Некоторые
    • Очаровательная
    • Веселый
    • Прозрачный
    • Крепление
    • Полный
    • Заключительный
    • Уверенный
    • Подтверждение
    • Конструктив
    • Непревзойденный
    • Убежден
    • Решено
    • Решительный
    • Определенный
    • Окончательный
    • Определено
    • Прямой
    • Догматический
    • Прямо
    • Действующий
    • Эмфатический
    • Обнадеживающий
    • Явный
    • Экспресс
    • Чрезвычайный
    • Сказочный
    • Фантастический
    • Благоприятный
    • Благоприятный
    • Штраф
    • Фирма
    • Квартира
    • Перспективный
    • Подлинный
    • Хорошо
    • Жесткий
    • Полезно
    • Обнадеживающий
    • Бесспорно
    • Неоспоримый
    • Невероятный
    • Бесспорно
    • Несомненно
    • Неопровержимый
    • Прекрасный
    • Чудесный
    • Оптимистичный
    • Оптимистично
    • Навылет
    • Прямо
    • Самонадеянный
    • Безапелляционный
    • Идеальный
    • Обычная
    • Плюс
    • позитивист
    • позитивистский
    • Практический
    • Продуктивный
    • Прогрессивный
    • Перспективный
    • Реальный
    • Обнадеживающий
    • Надежный
    • Решительный
    • Сангин
    • Безопасность
    • Уверенный в себе
    • Звук
    • Специальный
    • Великолепный
    • Успешно
    • Поддерживающий
    • Конечно
    • Тщательный
    • Всего
    • Однозначно
    • Безусловный
    • Бесспорно
    • Однозначно
    • Безошибочный
    • Полный
    • Неквалифицированный
    • Бесспорно
    • Приподнятый
    • Полезное
    • Полное
    • Добро пожаловать
    • Добро пожаловать

    Положительные синонимы Инфографика

    Штифт

    Другое слово для позитива

    Положительные синонимы с примерами

    Выучите другое слово со словом «позитивный» с примерами предложений.

    • Оптимистичный

    Теперь у нас более оптимистичный взгляд.

    • Обнадеживающий

    Все чувствуют себя прекрасно полны надежд в отношении будущего.

    • Уверенный

    Она прошла на съемочную площадку, выглядя безмятежно  уверенной .

    • Перспективный

    Нам нужно больше перспективного политического мышления.

    • Веселый

    Веселое сердце делает  веселое  лицо.

    • Кровавый

    Он казался довольно  оптимистичным  относительно своих шансов на успех.

    • Плавучий

    У нас было приподнятое настроение после победы в матче.

    • Гарантия

    Его манера публичного выступления все еще не очень  уверенная .

    • Оптимистичный

    Тон речи был оптимистичным .

    • Действующий

     Лекарство является эффективным средством от головной боли.

    • Полезное

    Кто-то сделал очень полезное предложение.

    • Полезный

    Она оставила полезных комментариев к моей работе.

    • Прогрессивный

     Это  прогрессивная идея.

    Еще интересные примеры со словом «положительный»

    • Переговоры прошли в положительном ключе.
    •  Вы уверены, что видели, как я выключил утюг?
    • Только один свидетель может подтвердить личность.
    • Вы должны более позитивно относиться к своей работе.
    • Помните, сохраняйте позитивный настрой, и все будет хорошо.
    • Она старалась относиться к своей новой работе более позитивно.
    • У вас есть доказательства того, что она взяла деньги?
    • Электрон имеет отрицательный заряд, протон — положительный.
    • Этот человек не только раздражает, но и представляет реальную угрозу!
    • Нас очень воодушевила положительная реакция общественности.
    • Его исключили из олимпийской сборной после положительного результата теста на наркотики.

    Синонимы к слову положительный с примерами | Инфографика

    Штифт

    Исследователи обнаружили, что шоколад и цветы ассоциируются с Днем святого Валентина

    Шоколад и розы — одни из самых популярных знаков любви в День святого Валентина. Но чтобы выяснить, почему это так, исследователи Корнельского университета начали новое исследование.Филипп О’Дрисколл рассказывает нам, что они узнали.

    День святого Валентина — это шанс выразить признательность этому особому человеку в вашей жизни.

    Исследователи из Корнельского университета считают, что это будет идеальный отпуск, чтобы изучить, как общие культурные события влияют на то, как мы относимся к обычным вещам.

    «Например, когда вы получаете красную розу в День святого Валентина, может ли это означать больше, потому что мы наполняем ее всеми этими другими ассоциациями о ее значении в отношении любви?» — спросила Вивиан Зайас, адъюнкт-профессор психологии Корнеллского университета.«И то же самое с шоколадом. Если вы получите коробку конфет в День святого Валентина, можем ли мы посмотреть на это по-другому, потому что теперь мы рассматриваем это через призму того, что это символизировало в нашей культуре?»

    Исследователи проанализировали данные Google о тенденциях и обнаружили, что эти товары имели предсказуемый всплеск в течение недели, предшествующей 14 февраля. Но, как показывают исследования, в другие праздники наблюдаются аналогичные закономерности.

    «День матери, вы получаете огромное количество роз, а у нас нет данных по … меняются ли оценки людей роз в День матери так же, как они меняются в День святого Валентина?» — сказал Зайас.

    В то время как восприятие цветов и шоколада становится более позитивным в преддверии праздника, у некоторых эти ассоциации распространяются и после 14 февраля.

    «В День святого Валентина я на самом деле не покупаю их, но через два дня мы с друзьями собираемся в Target купить конфеты, которые продаются по акции», — сказала второкурсница Корнелла Анджела Буи.

    Исследование не выявило аналогичного роста положительного отношения к рекламе онлайн-знакомств, вероятно, потому, что эти сайты не считаются символами любви.

    Как слово «проснулся» использовалось правыми в качестве оружия | Социальные тенденции

    Подобно слову «политкорректный», слово «проснулся» стало означать противоположное тому, что оно означает. Технически, следуя определению словаря Merriam-Webster, слово «woke» означает «осведомленный и активно внимательный к важным фактам и проблемам (особенно вопросам расовой и социальной справедливости)», но сегодня мы с большей вероятностью увидим, что его используют как палку которые побеждают людей, стремящихся к таким ценностям, которыми часто владеют те, кто не осознает, насколько они не проснулись, или гордятся этим фактом.

    В эти выходные Лоуренс Фокс пригвоздил себя к последней мачте, удвоив свою защиту привилегированного белого мужчины в статье «Время вопросов» на прошлой неделе в «Санди таймс» под заголовком «Почему я не буду встречаться с «проснувшимися» женщинами». Тоби Янг присоединился, аплодируя тому, как Фокс «терроризировал Вокерати», в то время как Солнце на прошлых выходных заклеймило Гарри и Меган «деспотичным королем и королевой Уоке».

    Для тех, кто в целом считает себя проснувшимся, это слово было использовано против них.Но бригада Fox/Young часто утверждает то же самое.

    Истоки woke, в этом контексте — созданные афроамериканскими сообществами — восходят как минимум к 60-м годам, но его повсеместное распространение — недавнее развитие. Подпитываемый чернокожими музыкантами, социальными сетями и движением #BlackLivesMatter, этот термин вошел в Оксфордский словарь английского языка только в 2017 году, к тому времени он стал не только модным словечком, но и набором ценностей. Некоторые из тех, кто не поспевает за тенденцией, чувствовали себя обделенными: если вы не знали значения слова «проснулся», значит, вас нет.

    Вместо того, чтобы прямо отвергать концепцию бодрствования, сегодняшние недоброжелатели часто заявляют, что они отвергают это слово как символ претенциозности и «культурной элитарности». Однако, как показали Фокс и другие, это в равной степени связано с вопросами расовой и социальной справедливости. Критика «культуры пробуждения» стала способом претендовать на статус жертвы для себя, а не признать, что более достойные другие имеют этот статус. Он превратился из сигнала добродетели в собачий свисток. Язык был успешно адаптирован, но пока остаются лежащие в основе несправедливости, будут появляться новые слова для их описания.

    E484K как инновационное филогенетическое событие эволюции вируса: геномный анализ спайковой мутации E484K в линиях SARS-CoV-2 из Бразилии

    Abstract

    Пандемия COVID-19, вызванная SARS-CoV-2, затронула миллионы людей с момента его появления в 2019 году. Распространение новых линий и открытие ключевых механизмов, принятых вирусом для перекрытия иммунной системы, являются центральными темами для всей политики общественного здравоохранения, исследований и лечения заболеваний.Со второго семестра 2020 года мутация E484K постепенно обнаруживается на территории Бразилии, со временем образуя разные линии. Это вызвало множество опасений, связанных с риском повторного заражения и эффективностью новых стратегий профилактики и лечения из-за возможности ускользания от нейтрализующих антител. Чтобы лучше охарактеризовать текущий сценарий, мы провели геномный и филогенетический анализ мутантных геномов E484K, секвенированных из бразильских образцов в 2020 году.С октября 2020 года более 40% секвенированных геномов содержат мутацию E484K, которая была идентифицирована в трех разных линиях (P1, P2 и B.1.1.33) в четырех регионах Бразилии. Мы также оценили наличие мутаций, связанных с E484K, и определили селективное давление, действующее на шиповидный белок, что привело нас к некоторому пониманию адаптивного и очищающего отбора, управляющего эволюцией вируса.

    Введение

    Этиологический агент COVID-19, названный SARS-CoV-2, принадлежит к семейству Coronaviridae , состоящему из оболочечных положительно ориентированных одноцепочечных РНК-вирусов (Zhu et al., 2020). Первые случаи заболевания были зарегистрированы в провинции Ухань, Китай, в декабре 2019 года. С тех пор число инфицированных во всем мире увеличилось в геометрической прогрессии, и 11 марта 2020 года Всемирная организация здравоохранения (ВОЗ) объявила о пандемии. По состоянию на 24 января , 2021 г., число подтвержденных случаев заболевания во всем мире увеличилось до 99 миллионов с более чем 2 миллионами смертей. Бразилия является третьей страной по общему количеству подтвержденных случаев заболевания, которое уже превышает 8,8 миллиона инфицированных и 216 445 смертей (Информационный центр по коронавирусу Джона Хопкинса, 2021 г.).

    Почти 410 000 геномов, секвенированных исследователями из нескольких стран, доступны в рамках Глобальной инициативы по обмену всеми данными о гриппе (GISAID) (Shu and McCauley, 2017), что имеет решающее значение для изучения геномной эпидемиологии SARS-CoV-2. Была предложена стандартизированная номенклатура, отражающая генетические характеристики и характер географического распространения вируса. Описаны две линии предков, А и В, содержащие сублинии, отличающиеся различными повторяющимися мутациями и филогенетическими профилями (Rambaut et al., 2020а). Совсем недавно особое внимание было направлено на понимание аспектов, которые могут повлиять на вирулентность и трансмиссивность SARS-CoV-2 (Korber et al. , 2020; Li, 2020; Toyoshima et al., 2020; Volz et al., 2020). ) и влияние различных мутаций на эффективность вакцин и иммунотерапии COVID-19 (Andreano et al., 2020; Pinto et al., 2020; Yu et al., 2020).

    Некоторые вирусные линии были изучены более подробно, в основном те, которые несут мутации в гликопротеине шипа (S), поскольку он является сайтом связывания с человеческим рецептором ACE2 (hACE2), что является важным шагом для проникновения в клетку-хозяин.В настоящее время существует три линии, вызывающие озабоченность во всем мире: B.1.1.7, B.1.351 и P.1. Первый появился в Англии в середине сентября 2020 г., характеризуется 14 аминокислотными заменами, характерными для конкретной линии, и с момента своего первого появления быстро распространился по Великобритании и Европе (Rambaut et al., 2020b). Две замены, присутствующие в этой линии, заслуживают особого внимания: N501Y в Receptor Binding Domain (RBD) S1 и P681H рядом с многоосновной последовательностью RRAR в фуриноподобной области расщепления. N501Y — один из ключевых контактных остатков, взаимодействующих с hACE2, а P681H — один из четырех остатков, содержащих вставку, создающую фуриноподобный сайт расщепления между S1 и S2, который не встречается у близкородственных коронавирусов (Xia et al., 2020). ). Вторая линия, вероятно, возникла в Южной Африке в августе 2020 г. и содержит три мутации в RBD: K417N, E484K и N501Y (Tegally et al., 2020). Самая последняя линия — P.1, происходящая от B.1.1.28, которая недавно была идентифицирована у вернувшихся путешественников из Манауса (штат Амазонас, Бразилия), прибывших в Японию.Он имеет почти те же три мутации, присутствующие в RBD, что и южноафриканская линия, за исключением замены в аминокислотном участке 417, где исходный лизин (K) заменен на треонин (T) вместо аспарагина (N). Его появление, вероятно, возникло независимо (Faria et al., 2021). В Бразилии мутация E484K (замена глутаминовой кислоты на лизин в аминокислоте 484) также возникла независимо и была идентифицирована в штате Рио-де-Жанейро (юго-восточная Бразилия) в начале октября. 2 линия (Волох и др., 2020).

    В настоящее время мутация E484K обнаружена в нескольких вирусных геномах из Бразилии. Из-за быстрого распространения, независимого происхождения и потенциальных последствий для вакцинации и пассивной иммунной терапии E484K с тех пор привлекает особое внимание. Важно отметить, что B.1.351, P.1 и P.2 несут эту замену, связанную с уходом от нейтрализующих антител (Baum et al., 2020; Greaney et al., 2020; Weisblum et al., 2020). Недавно эта мутация была также выявлена ​​в образце повторно инфицированного пациента (Nonaka et al., 2021). Эти два события свидетельствуют о способности вируса ускользать от иммунитета.

    Кроме того, B.1.1.7, B.1.351 и P.1 также содержат мутацию N501Y, которая связана с повышенной аффинностью к рецептору (Starr et al., 2020) и повышенной инфекционностью и вирулентностью в мышиной модели (Gu et al. др., 2020). Наличие замен E484K и N501Y в одном и том же геноме SARS-CoV-2 может иметь особое значение для эволюции вируса. Было показано, что эта комбинация вызывает больше конформационных изменений, чем один мутант N501Y, потенциально изменяя комплементарность антител к этой области, что приводит к вышеупомянутому феномену ускользания от иммунного ответа (Nelson et al. , 2021).

    Структурный анализ указывает на E484K как на потенциально наиболее важную мутацию на данный момент. Он создает новый сайт для связывания аминокислоты 75 hACE-2. Это взаимодействие кажется даже более сильным, чем связывание между hACE-2 и исходным основным сайтом, расположенным в положении 501 (на границе раздела RBD и hACE-2) (Nelson et al., 2021). Мы предполагаем, что последующее ускользание от нейтрализации из-за одного E484K или как часть более широкого массива различных мутаций может действовать как общее эволюционное решение для нескольких различных вирусных линий.Из-за независимого происхождения двух современных известных линий, содержащих E484K, в Бразилии, мы стремились описать модели мутаций этих линий, исследовать филогенетические отношения и провести тесты положительного отбора, чтобы определить, действовала ли адаптивная эволюция как основная эволюционная сила, ведущая к увеличению изменчивости аминокислот в сайтах RBD.

    Результаты

    Сравнительный геномный анализ

    Впервые обнаруженная в южноафриканской линии B. 1.351, мутация белка S1 E484K теперь присутствует в новых вариантах из Бразилии.Анализ геномов, содержащих E484K, загруженных из базы данных GISAID, показал распределение 169 аминокислотных остатков, соответствующих несинонимичным мутациям, и четыре делеции аминокислотных остатков в 134 бразильских образцах (таблица S1), собранных в период с октября по декабрь 2020 г. (рис. S1). Что касается синонимичных мутаций, 217 позиций генома имели переходы (рис. 1 и таблица S2), а 113 позиций генома имели связанные трансверсии (рис. 1 и таблица S2). Возникновение мутантных геномов E484K по крайней мере с четырьмя различными связанными паттернами мутаций для линий P.1, P.2 и B.1.1.33 можно увидеть с течением времени в выровненных геномах (рисунок S1 и таблица S1).

    Рисунок 1.

    Гистограмма частых мутаций, наблюдаемых в геномах бразильского SARS-CoV-2, несущих мутацию E484K. Красные метки над полосами указывают абсолютное положение нуклеотидов, а синие метки указывают на эффекты этих мутаций в соответствующих белках. Поскольку P.1 имеет только 19 представленных геномов и множественные мутации, были выделены только основные мутации, вызывающие озабоченность.

    UTR: непереведенная область; Syn: синонимичная замена; дел: удаление; ORF: открытая рамка чтения; Nsp: неструктурный белок; С: Спайк; E: конверт; М: Мембрана; N: Нуклеокапсид.

    Определяющие мутации B.1.1 были широко распространены почти во всех последовательностях, как и ожидалось ( например, S:D614G, N:R203K, N:G204R, 5’UTR: C241T и синонимичные замены в положениях нуклеотидов C3037T и C14408T) (рис. 1). ). Поскольку B.1.1.28 является наследственной линией P.1 и P.2, последовательности этих трех линий содержат мутации C12053T (Nsp7:L71F) и G25088T (S:V1176F). Четыре последовательности, классифицированные как B.1.1.33, несут его определяющие линию мутации (T27299C (ORF6: I33T) и T29148C (N: I292T)), но также имеют пять миссенс-мутаций в ORF1ab и одну в ORF7b (E33A).Этот шаблон указывает на новую линию, полученную из B.1. 1.33, которая также содержит замену E484K, как последовательности P.1 и P.2. Отличительной чертой этих бразильских линий является наличие множества определяющих линию мутаций в каждой линии (таблица 1).

    Таблица 1.

    Определяющие линию мутации каждой из трех бразильских линий, несущих мутацию E484K. Эти мутации не обязательно отражают мутации, определяющие назначение линии панголина, но были извлечены на основе их репрезентативности в большинстве последовательностей каждой линии (https://github.com/cov-lineages/панголин).

    Количество генетических изменений, связанных с каждой бразильской линией E484K, весьма разнообразно. B.1.1.33 (E484K) несет в своем геноме в среднем 19,2 (диапазон: 17-22) мутаций (рассматривая однонуклеотидные полиморфизмы, вставку и делецию как одно событие), в то время как P.1 обладает в среднем 30,1 изменениями (диапазон : 24-33). Несмотря на меньшее количество мутаций (в среднем: 18,5), геномы P.2 имеют самое высокое стандартное отклонение (SD = 2,2) и диапазон (15-25) среди этих линий. Эти данные свидетельствуют о том, что как P.1, так и P.2 циркулируют в Бразилии в течение более длительного периода и могут быстро развиваться.

    Анализ мутантной последовательности E484K EPI_ISL_832010, ранее обнаруженной в муниципалитете Эстейо, Риу-Гранди-ду-Сул, показывает более простой набор несинонимичных мутаций (n=10) по сравнению с другими. Этот геном сочетает в себе все распространенные замены D614G из шиповидного белка, N:R203K, N:G204R и Nsp12:P323L, связанные с другими очень частыми мутациями (S:V1176F, N:A119S, N:M234I, Nnp5:L205V и Nsp7). :L71F).Наблюдалось присутствие шипов S:D614G, N:R203K, N:G204R и Nsp12:P323L во всех секвенированных геномах, содержащих E484.

    Последние образцы, связанные с недавним кризисом общественного здравоохранения в штате Амазонас, показали выраженное увеличение количества расхождений (26 несинонимичных замен и 3 делеции аминокислот — Таблица S1) по сравнению с эталонным геномом SARS-CoV-2 (NC_045512.2). Что касается определяющих линию мутаций из линий P. 1, 14 из 19 геномов монофилетической группы амазонок представляют спайковые мутации L18F, T20N, P26S, D138Y и R190S.Таким образом, спайковый белок линии P.1 в этих бразильских мутантных геномах E484K характеризуется наличием переменного количества модифицированных сайтов без фиксации всех известных мутаций. На самом деле P.1 и P2. клады являются частью более крупной монофилетической группы, отделенной от B.1.1.33 и эталонного генома. Эти результаты подтверждают кластеризацию этих геномов в разных линиях (рис. 2 и рис. S2).

    Рисунок 2.

    Байесовский филогенетический вывод 134 бразильских мутантных геномов E484K.Кончики были окрашены в соответствии с бразильским штатом, а эталонный геном NC_045512.2 представлен черным цветом. Ветви были окрашены по родословной. Значения ветвей в ключевых ветвях указывают апостериорные вероятности.

    Определяющие линию мутации S:K471T, S:N501Y, S:T1027I, N:P80R, Nsp6:S106-107del, Nsp6:F108del и NS8:E92K были обнаружены только в группе P.1 и зарегистрированы для всех 19 Последовательности P. 1. Другие мутации, такие как S:V1176F, не были обнаружены только в линии B.1.1.33. Существуют также такие мутации, которые не известны как маркеры клонов, но были обнаружены во всех клонах (n=19) как Nsp3:K977Q, Nsp13:E341D и NS3:S253P.Также оценивали новые специфические одиночные замены (S:A27V, N:T16M, N:P151L, N:A267V, Nsp13:T216N и Nsp14:P443S). В частности, S:A27V расположен в N-концевом домене.

    Линия B.1.1.33, несущая мутацию E484K, была обнаружена в Сан-Паулу (n=3) и Амазонасе (n=1), в то время как последовательности P.1 были обнаружены только в штате Амазонас (n=19). Все остальные последовательности (n = 111) принадлежат к линии P.2, наиболее распространенной линии с учетом доступных на данный момент данных секвенирования. Северо-восточный регион был представлен последовательностями из Алагоаса (n=2), Параибы (n=3) и Баии (n=1).Северный регион представлен амазонскими последовательностями (n=6). Компания Southeast секвенировала 44 генома P.2, 36 из Рио-де-Жанейро и 8 из Сан-Паулу. Южная Бразилия классифицировала 55 геномов как P.2, 5 из Параны и 50 из Риу-Гранди-ду-Сул, что подтверждает его вероятное распространение во всех регионах Бразилии (рис. 3).

    Рисунок 3.

    Распределение геномов, содержащих мутацию E484K, в разных родословных (A) и штатах Бразилии (B) с октября по декабрь 2020 г.Значительное увеличение наблюдалось в октябре (n = 86), за которым последовали последовательные увеличения в ноябре (n = 366) и декабре (n = 374) (рис. 4А). Аналогичная тенденция наблюдалась в Бразилии, поскольку E484K наблюдался в последовательностях, полученных за октябрь (n = 31), ноябрь (n = 87) и декабрь (n = 40). Что наиболее важно, доля геномов, несущих эту замену, составляла 39,7%, 43,9% и 43,5% с октября по декабрь по сравнению со всеми геномами, секвенированными в Бразилии (рис. 4B). Мы полагаем, что этот явно медленно растущий паттерн в Бразилии связан с гетерогенными и ограниченными инициативами по секвенированию в стране, и, вероятно, эта замена уже широко распространена в бразильских штатах, поскольку она поддерживается тремя отдельными и явно независимыми развивающимися линиями.

    Рисунок 4.

    Ежемесячное присутствие мутации E484K с учетом доступных во всем мире данных (A) и бразильских геномов (B). Для ясности количество геномов в (A) представлено в масштабе log10.

    Анализ селекции

    Для надежного обнаружения сайтов, подвергшихся положительному/адаптивному или отрицательному/очищающему отбору, был протестирован случайный набор бразильских геномов с использованием различных подходов. Что касается моделей отдельных сайтов, байесовский вывод FUBAR (Fast, Unconstrained Bayesian AppRoximation) выявил восемь сайтов, развивающихся в условиях адаптивного отбора (положительный отбор) в последовательности спайков (таблица 2), с расчетными средними показателями синонимов и несинонимов, равными 1.227 и 0,857 соответственно. Для этих остатков под адаптивным давлением шесть включены в известные сайты мутаций шиповидного белка, включая E484K (L5F, S12F, P26S, D138Y, A688V).

    Таблица 2.

    Таблица сайтов FUBAR для положительно выбранных сайтов.

    Анализ с помощью программы codeml из пакета PAML подтвердил все положительно выбранные сайты, предсказанные FUBAR, а также показал высокую вариабельность селективного давления среди сайтов по сравнению M3 и M0 (p < 0,001) и положительный отбор по M2 против. Сравнение моделей M1 и M8 и M8a (p < 0,05) (табл. 3, 4 и 5). Расчеты замещения модели M3 достигли значения каппа (ts/tv) 2,82630 и доли сайтов 93,156% с расчетным значением омега (ω) 0,25424 (отрицательный отбор), в то время как 3,536% сайтов были оценены как ω = 4, (положительный отбор) (табл. 3). Оценка ω (ω = d N / d S ) является распространенным методом обнаружения положительного отбора, поскольку он предполагает, что синонимичные замены нейтральны, а несинонимичные подлежат отбору.Следовательно, значение ω, статистически превышающее 1, указывало бы на действие положительного отбора или ослабление селективного ограничения, тогда как низкие значения d N / d S означали бы сохранение генного продукта за счет очищающего отбора (Tennessen, 2008). ). В дополнение к результатам FUBAR были также рассмотрены три сайта с ω > 1 (табл. 3 и 5): 222, 626 и 1263. Из них только сайт 222 не связан с линиями, представляющими E484K (A626S и P1263L/S являются известный). Список положительно выбранных сайтов, идентифицированных моделью M8, доступен в таблице S4.

    Таблица 3.

    PAML (codeml): Оценки параметров и значения логарифмического правдоподобия в моделях переменных отношений ω между сайтами

    Таблица 4.

    PAML (codeml): Статистика отношения правдоподобия (2Δ/) для некоторых сравнений между моделями выбора

    Таблица 5.

    Таблица сайтов PAML (codeml) для положительно выбранных сайтов

    Чтобы избежать потенциальных ошибочных эффектов функции, утраченной в результате мутации последовательности, очищающий отбор действует как защитная модель.Подход FEL (вероятность с фиксированными эффектами) выявил 19 сайтов, подвергающихся отрицательному отбору (таблица 6). Три из них (189, 191 и 564) являются близкими остатками, представляющими известные несинонимичные мутации в мутантных геномах E484K, такие как S:R190S и S:F565L. Метод SLAC (Single-Likelihood Ancestor Counting) определил четыре сайта (55, 856, 943 и 1215), два из которых уже были предсказаны FEL. Преобладание отрицательного отбора в шиповидном белке согласуется с низкой частотой мутаций по всему геному, предполагаемой для SARS-CoV-2 (van Dorp et al., 2020).

    Таблица 6. Таблица сайтов

    FEL для отрицательно выбранных сайтов.

    Обсуждение

    Постоянство патогена внутри популяции хозяина зависит от его эффективности в ключевых процессах, таких как репликация, освобождение иммунной системы и связывание с клеточным рецептором. Мутации, которые создают благоприятный сценарий для ответа хозяина на инфекцию, повышают приспособленность патогена под давлением естественного отбора. Следовательно, коэволюция хозяина и патогена представляет собой важный механизм для понимания становления и прогнозирования патогенеза, поскольку инфекции, возможно, являются основным селективным давлением, воздействующим на человека (Sironi et al., 2015). Таким образом, циркуляция слабых и умеренных патогенов обеспечивает время для адаптации патогенов таким образом, что модуляция иммунитета может способствовать молекулярной конвергенции в разных линиях с течением времени (Longdon et al. , 2014).

    Наличие шипов S:D614G, N:R203K, N:G204R и Nsp12:P323L во всех секвенированных образцах с мутацией E484, достигающих трех разных линий, может указывать на то, что эти линии демонстрируют повышенную репликацию вируса. Учитывая, что E484K способствует ускользанию от антител иммунной системы, это потенциально может привести к вирусному преимуществу.Наличие одновременных мутаций N:R203K и N:G204R уже известно в литературе по SARS-CoV-2. Однако фиксация этих мутаций, а также Nsp12:P323L и D614G во всех оцененных геномах E484K может указывать на новые адаптивные отношения между этими модификациями, приводящие к успеху вирусной эволюции.

    Даже будучи независимым эволюционным событием, потенциальная фиксация мутаций, таких как E484K, в разных линиях может указывать на активные механизмы адаптивного отбора и очень важна при планировании будущих терапевтических стратегий (например, более новых вакцин и платформ иммунотерапии).Делеция трех аминокислот во второй спирали трансмембранного белка Nsp6 в геномах P. 1 может влиять на индуцированную вирусом клеточную аутофагию и образование двойных мембранных везикул для синтеза вирусной РНК (Benvenuto et al., 2020).

    Было высказано предположение о важной роли последующей стабилизации гибкого NTD мутациями (Laha et al., 2020). Как правило, NTD может содержать большее количество эволюционных событий, чем RBD, включая мутации, инсерции и делеции, которые могут действовать аллостерически, изменяя аффинность связывания между RBD и hACE-2 и вызывая уклонение от иммунного ответа.Известно, что отдельные положения могут иметь связанную связь в конечной структуре белка и могут проявлять некоторое преимущество, действуя вместе для достижения повышенной стабильности, адаптивности, жизнеспособности и/или эффективности передачи (Laha et al., 2020). Потенциальная причинно-следственная связь или влияние замен E484K и других на эффективность нейтрализующих антител, которые связывают N-концевой домен шиповидного белка (Chi et al., 2020), остается неопределенной.

    Что касается анализа отбора, метод FUBAR был протестирован первым.Согласно Murrell (2013), метод FUBAR может иметь большую мощность обнаружения, чем такие методы, как FEL, в частности, когда положительный отбор присутствует, но относительно слаб. Анализ южноафриканской клады V501.V2 (https://observablehq.com/@spond/zav501v2#table1) показал некоторые аналогичные результаты для оценки FUBAR с обнаружением адаптивного отбора на сайтах 5 (L5F), 12 ( S12F) и 484 (E484K). Остатки 155 и 677 не связаны с линиями, представляющими E484K, однако недавние данные обнаружили доказательства эволюционной конвергенции этой мутации по крайней мере в шести различных сублиниях, что может улучшить протеолитический процессинг, клеточный тропизм и трансмиссивность (Hodcroft et al. др., 2021). Аминокислотный остаток 677 находится рядом с фуриноподобным сайтом расщепления (от 678 до 688). Интересно, что некоторые исследования предполагают, что появление SARS-CoV-2 у человека произошло в результате замены пяти аминокислот в критическом сайте связывания S-гликопротеина (Fam et al. , 2020).

    Насколько нам известно, влияние E484K на различные линии не было глубоко изучено. Было структурно продемонстрировано, что, по крайней мере, в сочетании с K417N и N501Y, замена оказывает сильное влияние на смещение основного сайта контакта между вирусным RBD и остатками hACE-2 (Nelson et al., 2021). Однако мы до сих пор не знаем, верно ли это для других наборов мутаций, связанных с E484K.

    Таким образом, мы продемонстрировали широкое распространение мутантов, содержащих замену E484K, в географически различных регионах Бразилии. Эта замена была распространена в нашей стране еще в октябре 2020 г., хотя выводы филодинамики относят ее появление к июлю (Voloch et al., 2020). Тот факт, что E484K был обнаружен в контексте различных мутаций и родословных, позволяет предположить, что эта конкретная замена может действовать как общее решение для вирусной эволюции в разных генотипах.Эта гипотеза может быть связана с сильным воздействием мутации, которая заменяет отрицательно заряженную аминокислоту (глутаминовую кислоту) на положительно заряженную аминокислоту (лизин). Поскольку это положение присутствует в очень гибкой петле, было высказано предположение, что наличие такой мутации может создавать сильное ионное взаимодействие между лизином (К) в RBD и аминокислотой 75 рецептора hACE-2, смещая основные сайты связывания. в S1 с позиций 497-502 до 484 (Nelson et al., 2021).

    Мутации в RBD теоретически могут снизить нейтрализующую активность сыворотки пациентов, получающих вакцины против SARS-CoV-2, с неизвестными клиническими последствиями.Возможно, эффект E484K может быть особенно важным. В недавней публикации эта мутация была связана с полной отменой всей нейтрализующей активности в большой части протестированной сыворотки выздоравливающих (Wibmer et al., 2021). В совокупности эти растущие данные свидетельствуют о том, что E484K должен стать объектом интенсивного вирусологического надзора. Исследования, проверяющие активность сыворотки вакцинированных пациентов против вирусов или псевдовирусов с вышеупомянутой заменой, следует рассматривать в качестве высокого приоритета общественного здравоохранения. Иммунная терапия второго поколения и вакцины, ориентированные на более консервативные домены (например, в домене слияния S2), могут заслуживать особого внимания для обеспечения постоянной терапевтической эффективности.

    Методы

    Поиск данных секвенирования

    Для графической оценки бразильских родословных в анализ были включены все геномы, доступные в базе данных GISAID до 18 января -го года 2021 года и содержащие мутацию E484K. Были отобраны геномы из Бразилии и других стран, представленные до 24 января года года 2021 года и собранные с датами между 1 января года года и 31 декабря года года 2020 года.Подсчет геномов, содержащих Е484К, проводили по спецификации мутации в полях поиска. Ежемесячный счет определялся значениями между первым и последним днем ​​каждого месяца.

    Сравнительный геномный анализ

    Сравнительный геномный анализ мутантных геномов E484K был проведен для всех 134 геномов (таблица S1), представляющих мутацию E484K для Бразилии в GISAID до 18 января -го года 2021 года. выравнивание последовательностей выполняли на веб-сервере MAFFT (Katoh and Standley, 2013) с использованием параметров по умолчанию и матрицы оценки 1PAM = k/2.Однонуклеотидные полиморфизмы (SNP) и инсерции/делеции (INDEL) оценивались с использованием фрагмента, вызывающего конвейер v4.6.0 (https://github.com/tseemann/snippy). Мутации были объединены со связанными метаданными и подсчитаны бразильскими штатами с использованием пользовательских сценариев Python. Картирование выровненных последовательностей с функциями эталонного генома (NC_045512.2) было создано с помощью программного обеспечения GENEIOUS 2021.0.3 (https://www.geneious.com). Гистограмму мутаций строили с использованием модифицированного кода Lu et al.2020 г. (https://github.com/laduplessis/SARS-CoV-2_Guangdong_genomic_epidemiology/).

    Филогенетический анализ

    Ранее выровненные геномные последовательности использовались в качестве исходных данных для филогенетического анализа. Эталонный геном NC_045512.2 был добавлен в качестве внешней группы. Вывод наилучшей эволюционной модели был выполнен с помощью ModelTest-NG (Darriba et al., 2020), который определил GTR+I (Обобщенная обратимая во времени модель + доля инвариантных сайтов). Дерево было построено методом байесовского вывода в MrBayes v3.2.7 (Huelsenbeck and Ronquist, 2001) с моделью GTR+I и 5 миллионами поколений. Сходимость данных оценивалась с помощью Tracer v1.7.1 (Rambaut et al., 2018), а визуализация дерева была создана с помощью программного обеспечения FigTree (http://tree.bio.ed.ac.uk/software/figtree/).

    Для филогенетического анализа с использованием шиповидного белка ранее полученное множественное выравнивание последовательностей было отредактировано, и были сохранены только кодирующие шиповидные последовательности. Вывод эволюционной модели и построение дерева производились по описанной модели: выбор модели ModelTest-NG, метод MrBayes с GTR+I и 10 млн поколений.

    Селекционный анализ

    Всего для этого анализа было использовано 780 геномов SARS-CoV-2, собранных в образцах Бразилии в период с 1 февраля года по 31 декабря года года, доступных в GISAID. После начального этапа фильтрации неопределенных нуклеотидов в области шиповидного белка с удалением геномов с отношением N > 0,01 было отобрано 589 геномов. На втором этапе субвыборки с помощью набора инструментов Augur (Huddleston et al., 2021) было сохранено 498 геномов (примерно 119 репрезентативных геномов на линию) для множественного выравнивания последовательностей (таблица S3).Геномное множественное выравнивание последовательностей было выполнено с помощью MAFFT (Katoh and Standley, 2013) с параметрами по умолчанию и оценочной матрицей 1PAM = k/2. Выбор местоположения шиповидного белка в геноме проводили с помощью программы UGENE (Оконечников и др., 2012), используя в качестве параметра координаты ORF эталонного генома NC_045512. МодельGTR+I была признана ModelTest-NG (Darriba et al., 2020) лучшей эволюционной моделью последовательностей спайков. ModelTest-NG также показал идентичные последовательности, которые были удалены, что привело к 161 последовательности.Байесовский филогенетический вывод был выполнен с помощью MrBayes v3. 2.7 с использованием этих 161 уникальной выбранной последовательности шипа и 5 миллионов поколений. Сходимость данных оценивалась с помощью Tracer v1.7.1.

    Анализ сайтов при положительном и отрицательном отборе был выполнен HyPhy v2.5.23 (Pond et al., 2005) в соответствии с различными подходами: (i) FUBAR (неограниченная байесовская аппроксимация) (Murrell et al., 2013), ( II) FEL ( F IXED E FFECTS L IKeliood L IKeliood) (Kosakovsky Pond and Frost, 2005), и (III) SLAC ( S Ingle- L Ikelihoe A Ncestor C (Косаковский пруд и Мороз, 2005).Наконец, программа PAML (филогенетический анализ по максимальному правдоподобию) (Yang, 2007) использовалась для подтверждения возможно выбранных сайтов с помощью пакета codeml. Все модели запускались с использованием опции F3×4 в программе PAML, где ожидаемые частоты кодонов основывались на частотах нуклеотидов, встречающихся в трех положениях кодонов. Модель с одним отношением (M0) предполагает одно отношение ω для всех сайтов. Нейтральная модель (М1) предполагает соотношение p 0 консервативных сайтов с ω 0 = 0 и p 1 = 1 — p 0 нейтральных сайтов с ω 1 = 1, как это было бы, если почти все несинонимичные замены были либо вредными, либо нейтральными.Модель положительного отбора (М2) добавляет дополнительный класс сайтов с частотой p 2 = 1 — p 0 — p 1 , а ω 2 оценивается по данным. В дискретной модели (M3) вероятности (p 0 , p 1 и p 2 ) каждого сайта, который был подвергнут очищающему отбору, нейтральному отбору и положительному отбору, соответственно, и их соответствующие отношения w ( ω 0 , ω 1 , ω 2 ) выводятся из данных.Бета-модель (M7) является нулевым тестом для положительного отбора, предполагая бета-распределение с ω между 0 и 1. Наконец, бета-модель и ω (M8) добавляет один дополнительный класс с тем же соотношением ω 1 . LRT (тесты отношения правдоподобия) были протестированы, чтобы выяснить, значительно ли ω отличается от 1 для каждого попарного сравнения: M1a против . M2a, M0 против . M3 и M7 против . М8. LRT выполняет сравнение как с ограничением ω=1, так и без него: LRT = 2 (ln 1 — ln 2 ).Эти статистические данные LRT примерно соответствуют распределению хи-квадрат, а количество степеней свободы равно количеству дополнительных параметров в более сложной модели. Для отклонения нулевой гипотезы о нейтральности считали p ≤ 0,05. Наконец, мы применили подходы Naive Empirical Bayes (NEB) и Bayes Empirical Bayes (BEB), доступные в пакете PAML, для расчета апостериорной вероятности того, что каждый сайт принадлежит к положительно выбранному классу.

    Заявление о конкурирующих интересах

    Авторы не заявляют о конкурирующих интересах.

    Финансирование

    Стипендии и стипендии были предоставлены Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior – Brasil (CAPES) – Финансовый кодекс 001 и Федеральным университетом наук в Порту-Алегри. Спонсоры не участвовали в разработке исследования, сборе и анализе данных, принятии решения о публикации или подготовке рукописи.

    Авторские вклады

    C.E.T. и Р.А.З. задумал исследование. C.E.T., P.A.G.F., V.B.F. предоставил инструменты биоинформатики.C.E.T., P.A.G.F., R.A.Z., V.B.F. провел анализ данных. A.M.M., C.E.T., G.D.C., P.A.G.F., R.A.Z., V.B.F. написал рукопись.

    Дополнительный материал

    Столы

    Стол S1. бразильских секвенированных геномов, содержащих мутацию E484K.

    Таблица S2. однонуклеотидных полиморфизмов, выявленных при сравнении нескольких геномов.

    Таблица S3. бразильских секвенированных геномов, использованных для селекционного анализа (499 последовательностей).

    Рисунок S1.

    Множественное выравнивание последовательностей (упорядоченное по времени) 134 секвенированных бразильских геномов с мутацией E484K. Геномы, полученные из GISAID до 18 января года года 2020 года.

    Рисунок S2.

    Филогенетический анализ 134 белковых последовательностей Spike с мутацией E484K из бразильских геномов. Дерево, полученное MrBayes с использованием эволюционной модели GTR+IN. Значения в ключевых кладах указывают на апостериорные вероятности и родословные.

    Рисунок S3.

    Филогенетический анализ 161 уникальной последовательности шиповидных белков из бразильских геномов.Дерево, полученное MrBayes с использованием эволюционной модели GTR+I.

    Благодарности

    Мы благодарим администраторов и кураторов базы данных GISAID и исследовательские группы по всему миру за поддержку быстрого и прозрачного обмена геномными данными во время пандемии COVID-19. Мы также благодарим мэрию, Департамент здравоохранения и больницу Сан-Камило (Эстейо, штат РС, Бразилия), Леонардо Дуарте Паскоала и Ану Регину Болл за их работу по борьбе с Covid-19 и за поддержку работы, разработанной нашей исследовательской группой.Полную таблицу с указанием авторов и соответствующих лабораторий, предоставивших данные секвенирования, использованные в этом исследовании, можно найти в дополнительных файлах 1 и 3.

    Добавить комментарий

    Ваш адрес email не будет опубликован.

    2015-2019 © Игровая комната «Волшебный лес», Челябинск
    тел.:+7 351 724-05-51, +7 351 777-22-55 игровая комната челябинск, праздник детям челябинск