Вектор задать: с примерами. Просто и понятно! — Детская игровая комната «Волшебный лес»

Posted on 26.03.202029.04.2021 by alexxlab

Содержание

Объекты и типы данных R: векторы

Язык R принадлежит к семейству так называемых высокоуровневых объектно-ориентированных языков программирования. Для неспециалиста строгое определение понятия «объект» является достаточно абстрактным. Однако для простоты можно называть объектами все, что мы создаем в ходе работы с R. Их выделяют два основных типа:

Объекты, предназначенные для хранения данных («data objects») – это векторы, матрицы и массивы, списки, факторы, таблицы данных;
Функции («function objects») – это поименованные программы, предназначенные для выполнения определенных действий над другими объектами.

В этом сообщении расмотрены векторы, способы их создания в R, а также основные операции над ними.

Вектор представляет собой поименованный одномерный объект, содержащий набор однотипных элементов (числовые, логические, либо текстовые значения — никакие сочетания не допускаются). Для создания векторов небольшой длины в R используется т.

н. функция конкатенации c() (от «concatenate» – объединять, связывать). В качестве аргументов этой функции через запятую перечисляют объединяемые в вектор значения, например:

my.vector <- c(1, 2, 3, 4, 5)
my.vector
[1] 1 2 3 4 5

Вектор можно создать также при помощи функции scan(), которая «считывает» последовательно вводимые с клавиатуры значения:

X <- scan()
1: 2.9 # после каждого нового значения нажать клавишу "Ввод"
2: 3.1
3: 3.4
4: 3.4
5: 3.7
6: 3.7
7: 2.8
8: 2.5 
9: # выполнение команды scan завершают введением пустой строки
Read 8 items  # программа сообщает о считывании 8 значений
X
[1] 2.9 3.1 3.4 3.4 3.7 3.7 2.8 2.5

Один из недостатков создания векторов при помощи функции scan() состоит в том, что если при вводе значений с клавиатуры допущена ошибка, то придется либо начать ввод заново, либо воспользоваться специальными инструментами корректировки (например, функцией

fix(); здесь эти способы не рассматриваются).

Для создания векторов, содержащих совокупность последовательных чисел, удобна функция seq() (от «sequence» – последовательность). Так, вектор с именем S, содержащий совокупность целых чисел от 1 до 7, можно создать следующим образом:

S <- seq(1,7)
S
[1] 1 2 3 4 5 6 7

Идентичный результат будет получен при помощи команды

S <- 1:7
S
[1] 1 2 3 4 5 6 7

В качестве дополнительного аргумента функции seq() можно задать шаг приращения чисел:

S <- seq(from = 1, to = 5, by = 0.5)
S
[1] 1.0 1.5 2.0 2.5 3.0 3.5 4.0 4.5 5.0

Векторы, содержащие одинаковые значения, создают при помощи функции rep() (от «repeat» – повторять). Например, для формирования текстового вектора Text, содержащего пять значений «test», следует выполнить команду

Text <- rep(«test», 5)

Text
[1] "test" "test" "test" "test" "test"

Система R способна выполнять самые разнообразные операции над векторами. Так, несколько векторов можно объединить в один, используя уже рассмотренную выше функцию конкатенации

v1 <- c(1, 2, 3)
v2 <- c(4, 5, 6)
V <- c(v1, v2)
V
[1] 1 2 3 4 5 6

Если попытаться объединить, например, текстовый вектор с числовым, сообщение об ошибке не появится – программа просто преобразует все значения в текстовые:

# создаем текстовый вектор text.vect:
text.vect <- c("a", "b", "c")
# объединяем числовой вектор v1 (см. выше) с текстовым вектором text.vect:
# new.vect <- c(v1, text.vect)
# просмотр содержимого нового вектора new.vect:
new.vect
[1] "1" "2" "3" "a" "b" "c"
# все значения нового вектора взяты в кавычки,
# что указывает на их текстовую природу;
# для подтверждения этого воспользуемся командой mode():
mode(new.vect)
[1] "character" # все верно: "character" значит "текстовый"

Для работы c определенным элементом вектора необходимо уметь отличать его от других похожих элементов. Для этого при создании вектора всем его компонентам автоматически присваиваются индексные номера, начиная с 1. Чтобы обратится к конкретному элементу необходимо указать имя вектора и индекс этого элемента в квадратных скобках:

# создадим числовой вектор y, содержащий 5 числовых значений:
y <- c(5, 3, 2, 6, 1)
# проверим, чему равен третий элемент вектора y:
y[3]
[1] 2

Используя индексные номера, можно выполнять различные операции с избранными элементами разных векторов:

# создадим еще один числовой вектор z, содержащий 3 значения:
z <- c(0.5, 0.1, 0.6)
# умножим первый элемент вектора y на третий элемент вектора z (т.е. 5*0.6):
y[1]*z[3]
[1] 3

Индексирование является мощным инструментом, позволяющим создавать совокупности значений в соответствии с определенными критериями. Например, для вывода на экран 3-го, 4-го и 5-го значений вектора y необходимо выполнить команду

Из этого же вектора мы можем выбрать, например, только первое и четвертое значения, используя уже известную нам функцию конкатенации с():

Похожим образом мы можем удалить первое и четвертое значения из вектора y, применив знак «минус» перед функцией конкатенации:

y[-с(1, 4)]
[1] 3 2 1

В качестве критерия для выбора значений может служить логическое выражение. Для примера выберем из вектора y все значения >2:

Ниже перечислены все используемые в R логические операторы:

«Равно» ==
«Не равно» !=
«Меньше» <
«Больше» >
«Меньше либо равно» <=
«Больше либо равно» >=
«Логическое И» &
«Логическое ИЛИ» |
«Логическое НЕ» !

Индексирование является также удобным инструментом для внесения исправлений в имеющихся векторах. Например, так можно исправить второе значение созданного нами ранее вектора z с 0.1 на 0.3:

z[2] <- 0.3
z
[1] 0.5 0.3 0.6

Для упорядочения значений вектора по возрастанию или убыванию используют функцию sort() в сочетании с аргументом decreasing = FALSE или decreasing = TRUE соответственно («decreasing» значит «убывающий»):

sort(z, decreasing = FALSE)
[1] 0.3 0.5 0.6
sort(z, decreasing = TRUE)
[1] 0.6 0.5 0.3

Дополнительную информацию на русском языке о векторах и других объектах R можно найти здесь и здесь.

--

Создано при помощи Pretty R на сайте inside-R.org

Vector3 Структура (System.Numerics) | Microsoft Docs

Vector3Структура обеспечивает поддержку аппаратного ускорения.The Vector3 structure provides support for hardware acceleration.

В матричных преобразованиях экземпляры Vector2, Vector3 и Vector4 отображаются в виде строк: вектор v преобразуется матрицей M с помощью умножения vM.For matrix transformations, the Vector2, Vector3, and Vector4 instances are represented as rows: a vector v is transformed by a matrix M with vM multiplication.

Vector3(Single)	Создает новый объект Vector3 с тремя элементами, имеющими одинаковое значение.Creates a new Vector3 object whose three elements have the same value.
Vector3(Single, Single, Single)	Создает вектор, элементы которого имеют заданные значения.Creates a vector whose elements have the specified values.
Vector3(Vector2, Single)	Создает новый объект Vector3 на основе заданного объекта Vector2 и значения.Creates a new Vector3 object from the specified Vector2 object and the specified value.
X	Координата X вектора.The X component of the vector.
Y	Координата Y вектора.The Y component of the vector.
Z	Координата Z вектора.The Z component of the vector.
One	Получает вектор, три элемента которого равны единице.Gets a vector whose 3 elements are equal to one.
UnitX	Получает вектор (1,0,0).Gets the vector (1,0,0).
UnitY	Получает вектор (1,0,0).Gets the vector (0,1,0).
UnitZ	Получает вектор (0,0,1). Gets the vector (0,0,1).
Zero	Получает вектор, три элемента которого равны нулю.Gets a vector whose 3 elements are equal to zero.
Abs(Vector3)	Возвращает вектор, элементы которого являются абсолютными значениями каждого из элементов заданного вектора.Returns a vector whose elements are the absolute values of each of the specified vector’s elements.
Add(Vector3, Vector3)	Складывает два вектора.Adds two vectors together.
Clamp(Vector3, Vector3, Vector3)	Ограничивает минимальное и максимальное значение вектора.Restricts a vector between a minimum and a maximum value.
CopyTo(Single[])	Копирует элементы вектора в заданный массив.Copies the elements of the vector to a specified array.
CopyTo(Single[], Int32)	Копирует элементы вектора в заданный массив, начиная с указанной позиции индекса. Copies the elements of the vector to a specified array starting at a specified index position.
Cross(Vector3, Vector3)	Вычисляет векторное произведение двух векторов.Computes the cross product of two vectors.
Distance(Vector3, Vector3)	Вычисляет евклидово расстояние между двумя заданными точками.Computes the Euclidean distance between the two given points.
DistanceSquared(Vector3, Vector3)	Возвращает квадрат евклидова расстояния между двумя заданными точками.Returns the Euclidean distance squared between two specified points.
Divide(Vector3, Single)	Делит заданный вектор на указанное скалярное значение.Divides the specified vector by a specified scalar value.
Divide(Vector3, Vector3)	Делит первый вектор на второй. Divides the first vector by the second.
Dot(Vector3, Vector3)	Возвращает скалярное произведение двух векторов.Returns the dot product of two vectors.
Equals(Object)	Возвращает значение, указывающее, равен ли данный экземпляр указанному объекту.Returns a value that indicates whether this instance and a specified object are equal.
Equals(Vector3)	Возвращает значение, указывающее, равен ли данный экземпляр другому вектору.Returns a value that indicates whether this instance and another vector are equal.
GetHashCode()	Возвращает хэш-код данного экземпляра.Returns the hash code for this instance.
Length()	Возвращает длину данного объекта вектора.Returns the length of this vector object.
LengthSquared()	Возвращает длину вектора в квадрате. Returns the length of the vector squared.
Lerp(Vector3, Vector3, Single)	Выполняет линейную интерполяцию между двумя векторами на основе заданного взвешивания.Performs a linear interpolation between two vectors based on the given weighting.
Max(Vector3, Vector3)	Возвращает вектор, элементы которого являются максимальными значениями каждой пары элементов в двух заданных векторах.Returns a vector whose elements are the maximum of each of the pairs of elements in two specified vectors.
Min(Vector3, Vector3)	Возвращает вектор, элементы которого являются минимальными значениями каждой пары элементов в двух заданных векторах.Returns a vector whose elements are the minimum of each of the pairs of elements in two specified vectors.
Multiply(Single, Vector3)	Умножает скалярное значение на заданный вектор. Multiplies a scalar value by a specified vector.
Multiply(Vector3, Single)	Умножает вектор на заданный скаляр.Multiplies a vector by a specified scalar.
Multiply(Vector3, Vector3)	Возвращает новый вектор, значения которого являются произведением каждой пары элементов в двух заданных векторах.Returns a new vector whose values are the product of each pair of elements in two specified vectors.
Negate(Vector3)	Преобразует заданный вектор в отрицательный.Negates a specified vector.
Normalize(Vector3)	Возвращает вектор с тем же направлением, что и заданный вектор, но с длиной равной единице.Returns a vector with the same direction as the specified vector, but with a length of one.
Reflect(Vector3, Vector3)	Возвращает отражение вектора от поверхности, которая имеет заданную нормаль. Returns the reflection of a vector off a surface that has the specified normal.
SquareRoot(Vector3)	Возвращает вектор, элементы которого являются квадратным корнем каждого из элементов заданного вектора.Returns a vector whose elements are the square root of each of a specified vector’s elements.
Subtract(Vector3, Vector3)	Вычитает второй вектор из первого.Subtracts the second vector from the first.
ToString()	Возвращает строковое представление текущего экземпляра, используя форматирование по умолчанию.Returns the string representation of the current instance using default formatting.
ToString(String)	Возвращает строковое представление текущего экземпляра, используя заданную строку форматирования для форматирования отдельных элементов.Returns the string representation of the current instance using the specified format string to format individual elements.
ToString(String, IFormatProvider)	Возвращает строковое представление текущего экземпляра, используя заданную строку форматирования для форматирования отдельных элементов и заданный поставщик формата для указания форматирования, определяемого языком и региональными параметрами.Returns the string representation of the current instance using the specified format string to format individual elements and the specified format provider to define culture-specific formatting.
Transform(Vector3, Matrix4x4)	Преобразует вектор посредством заданной матрицы 4×4.Transforms a vector by a specified 4×4 matrix.
Transform(Vector3, Quaternion)	Преобразует вектор посредством заданного значения поворота кватерниона.Transforms a vector by the specified Quaternion rotation value.
TransformNormal(Vector3, Matrix4x4)	Преобразует нормаль вектора посредством заданной матрицы 4×4. Transforms a vector normal by the given 4×4 matrix.
Addition(Vector3, Vector3)	Складывает два вектора.Adds two vectors together.
Division(Vector3, Single)	Делит заданный вектор на указанное скалярное значение.Divides the specified vector by a specified scalar value.
Division(Vector3, Vector3)	Делит первый вектор на второй.Divides the first vector by the second.
Equality(Vector3, Vector3)	Возвращает значение, указывающее, равна ли каждая пара элементов в двух заданных векторах.Returns a value that indicates whether each pair of elements in two specified vectors is equal.
Inequality(Vector3, Vector3)	Возвращает значение, указывающее на неравенство двух заданных векторов.Returns a value that indicates whether two specified vectors are not equal.
Multiply(Single, Vector3)	Умножает скалярное значение на заданный вектор.Multiples the scalar value by the specified vector.
Multiply(Vector3, Single)	Умножает заданный вектор на указанное скалярное значение.Multiples the specified vector by the specified scalar value.
Multiply(Vector3, Vector3)	Возвращает новый вектор, значения которого являются произведением каждой пары элементов в двух заданных векторах.Returns a new vector whose values are the product of each pair of elements in two specified vectors.
Subtraction(Vector3, Vector3)	Вычитает второй вектор из первого.Subtracts the second vector from the first.
UnaryNegation(Vector3)	Преобразует заданный вектор в отрицательный.Negates the specified vector.

Ход торгов. Газпром продолжает задавать вектор движения российского рынка

Котировки на 12:50 МСК

Индексы
Индекс МосБиржи: 2700,98 п. (-1,05%)
Индекс РТС: 1303,56 п. (-0,87%)

О главном

Российский рынок перешел к коррекции после вчерашнего роста. Как и накануне вектор движения задают бумаги Газпрома

Позитивные факторы
— Замедление темпов ужесточения монетарной политики США
— Надежда на торговую сделку между США и КНР
— Решение ОПЕК+ о сокращении объемов добычи нефти
— Надежды на улучшение взаимоотношений между США и РФ
— Повышенные спрос на отдельные бумаги российского рынка

Негативные факторы
— Риски введения жесткого варианта санкций против РФ
— Опасения замедление роста мировой экономики
— Риски продолжения торговой войны
— Нефтяные котировки опустились ниже $60,34 за баррель марки Brent

В деталях

Российский рынок перешел к коррекции после вчерашнего роста. Как и накануне вектор движения задают бумаги Газпрома. К 12:50 МСК индекс МосБиржи теряет 1,05%, индекс РТС в минусе на 0,87%. Национальная валюта движется в противоположном направлении и укрепляется как к доллару, так и к евро.

Внешний фон к текущему моменту складывается смешанный. Торговые конфликты и риски замедления роста мировой экономики продолжает нервировать участников рынка. Эксперты Morgan Stanley выразили мнение, что продолжения торговой войны, может привести экономику США к рецессии в течение года. Опубликованные накануне данные по активности в производственном секторе Штатов не добавили оптимизма. Однако ухудшение ситуации может вынудить ФРС снизить ставки, и эти ожидания оказывают поддержку рынкам.

Азия закрыла день преимущественно в минусе. Гонконгский Hang Seng и китайский Shanghai Composite опустились на 0,61% и на 0,96% соответственно. Японский Nikkei не претерпел изменений.

Европейские площадки окрашены в зеленый цвет. Индекс 50 крупнейших европейских компаний Euro Stoxx 50 к 12:50 МСК торгуется в плюсе на 0,4%. Опубликованные данные по инфляции оказались хуже ожиданий рынка, а вот безработица в еврозоне снизилась в апреле до 7,6%.

Американские фьючерсы с утра прибавляют в среднем по 0,4% после преимущественно негативной динамики накануне. Основное давление испытали на себе бумаги высокотехнологического сектора. Слухи о том, что Минюст США планирует провести расследование нарушения антимонопольного законодательства такими компаниями, как Alphabet, Facebook, Amazon, Apple и Facebook, увели акции этих компаний в минус. Отчасти поддержку рынку оказали заявления глава ФРБ Сент-Луиса Джеймс Буллард о возможной необходимости снижения ключевой ставки в ближайшее время. Сегодня инвесторы будут ждать намеков на такую вероятность от главы ФРС Джерома Пауэлла на конференции по монетарной политике в Чикаго (16:55 МСК).

Нефтяные котировки в первой половине дня продолжают снижаться. К 12:50 МСК рынок оценивает стоимость барреля марки Brent в $60,3. Отчасти поддержку черному золоту могут оказать заявления представителей ОПЕК+ о намерениях регулировать рынок. Так, министр энергетики Саудовскои? Аравии уже отметил, что организация сделает все необходимое для поддержания стабильности рынка после июня. «Для меня это означает сокращение запасов с их нынешнего повышенного уровня», — цитирует его Arab News.

Российский рынок перешел к коррекции после вчерашнего роста, обеспеченного рывком акций Газпрома, а также других акций, поддержавших этот подъем. Бумаги вчерашнего локомотива снижаются сегодня на 3,4%. К ним в красной зоне присоединились акции Лукойла, Сбербанка. Именно продажи в этих активах увели отечественные индексы в минус.

Текущая неделя обещает быть богатой на события. Завтра будут опубликованы показатели деловой активности в сфере услуг в Китае, еврозоне и США; в четверг пройдет заседание ЕЦБ и будут представлены пересмотренные данные по ВВП региона; в пятницу ждем ключевого отчета по рынку труда в США. В четверг стартует Петербургский международный экономический форум, новости с которого также могут повысить активность участников торгов.

Корпоративный сектор

В аутсайдерах во вторник оказался отраслевой индекс нефтегазового сектора. Продажи в бумагах Газпорма и Лукойла обеспечили его снижение на 0,9%.

В минус сегодня ушли отраслевые индексы финансового сектора и представители химпроизводства. Корректируются вниз более, чем на 1% бумаги Сбербанка. В то же время подрастают акции МосБиржи и Qiwi. Уверенно идут вверх бумаги Системы. Компания опубликовала неплохой отчет за I квартал 2019 г.

Около вчерашних уровней консолидируется отраслевой индекс потребительского сектора. Более 1% прибавляют акции Детского мира, продолжат рост после публикации отчетности бумаг Магнита. В то же время в минус ушли акции Яндекса, негативно отреагировавшие на новости о том, что ФСБ запросила у компании ключи для дешифровки данных пользователей сервисов «Яндекс.Почта» и «Яндекс.Диск».

В зеленой зоне курсируют отраслевые индексы транспортного, энергетического и металлургического сектора. Растут бумаги Аэрофлота, Русала, Алросы, ФСЕК ЕЭС.

БКС Брокер

Лечение и чистка аппаратом Вектор (Vector) в Санкт-Петербурге

Инновационная разработка немецкого производителя — аппарат Vector, — один из эффективных инструментов профилактики и лечения воспалительных заболеваний тканей пародонта. Процедура на этом аппарате имеет сразу два терапевтических эффекта — от воздействия ультразвуком и подачи специальной смеси с активными компонентами.

С помощью использования аппарата удается не только избавиться от зубных отложений на поверхности коронок зубов, но и удалить камень из зубодесневых карманов. При этом чистка аппаратом «Вектор» является менее травматичной альтернативой кюретажу — механическому удалению твердого налета из карманов. Вибрация создает ультразвуковое поле, призванное удалить мягкие и твердые зубные отложения — налет и камень. Уже за 1–2 сеанса удается достичь выраженного результата при лечении пародонтита, отек и болезненность становятся меньше.

Преимущества аппарата

Лечебный состав, который используется во время процедуры, содержит гидроксиапатит — основной минерал эмали зуба. Благодаря этому удается существенно снизить чувствительность зубов. Бесконтактное разрушение и удаление зубного камня путем воздействия ультразвуковыми вибрациями также не доставляет болезненных ощущений.

Выделяют еще несколько преимуществ метода:

отсутствие необходимости в обезболивании — особенно актуально для пациентов, которые плохо переносят местные анестетики;
глубокая чистка — аппарат оснащен гибкими инструментами. И если обычный ультразвуковой аппарат обеспечивает чистоту на глубине до 5 мм, то «Вектор» — до 11 мм. Это позволяет отказаться от хирургического вмешательства у пациентов со второй и третьей стадией пародонтоза, а также тщательно очистить каждый участок эмали, работать с изгибами;
эффективное устранение симптомов — ткани пародонта быстро восстанавливаются, проходят кровоточивость, гноетечение из десневых карманов. Десны приобретают здоровую структуру и цвет. С помощью аппарата удается обеспечить лучшее прикрепление десны к зубу и приостановить процессы рецессии тканей;
полировка гладкой поверхности твердых тканей зуба — это отличная профилактика скопления зубного налета, который значительно легче формируется на шероховатой эмали.

Важно помнить и о том, что чистка зубов «Вектором» — единственный эффективный способ гигиены при наличии металлокерамических протезов и имплантатов.

Показания к лечению на аппарате «Вектор»

Система Vector Paro показана для удаления твердых зубных отложений, в том числе у пациентов с повышенной чувствительностью зубов. Она может служить действенной профилактической мерой и предупреждать заболевания пародонта. Также систему эффективно применяют в стоматологии при комплексном лечении пародонтита и периимплантита. Удаление налета, а вместе с ним болезнетворных бактерий, способствует снятию воспалительного процесса. Кроме того, после лечения десен «Вектором» удается достичь стойкой и длительной ремиссии.

Если имеются ортопедичские коронки, то рекомендуется проходить лечение оптимально — дважды в год. Ортопедические конструкции требуют тщательного ухода. Регулярная профилактическая чистка продлевает срок службы коронок.

При установке имплантов врач также порекомендует соблюдать гигиену. Для этого используются специальные неметаллические насадки на ультразвуковой аппарат — имплагеры. С помощью такой обработки удается создать стойкое здоровое поле вокруг имплантата, что снижает риск развития осложнений и воспалительных заболеваний.

Менее распространенным показанием к применению аппарата является кариес. С его помощью можно проводить препарирование, но только при начальной стадии разрушения эмали. Процедура безболезненна и предусматривает использование пасты с абразивным действием. После обработки врач может использовать обычные пломбировочные материалы, при этом гарантируется отличное краевое прилегание пломбы к тканям зуба.

Лечение десен аппаратом Vector в Санкт-Петербурге предлагают клиники «СТОМА».

Цены на лечение аппаратом «Вектор»

Закрытый кюретаж при помощи аппарата «Vector»

сегмент (4-6 зубов)

с одной челюсти

импланта (за единицу)

Задать правильный вектор

28.02.2018 09:45:00

Задать правильный вектор

Благотворительный фонд «Волонтеры в помощь детям-сиротам» и уполномоченный по правам ребенка в Тульской области вновь приглашает волонтеров в проект «Наставничество» в Туле!

В жизни каждого из нас были люди, оказавшие влияние на формирование наших интересов, выбор профессии, жизненных ценностей. Заботливое участие значимого взрослого — необходимая составляющая детства. А для ребенка, оставшегося без опеки родителей — это путь к социализации и познанию мира за стенами государственного учреждения.

Если вы чувствуете в себе запас жизненной энергии, душевной теплоты и готовность стать чутким другом, будем рады видеть вас среди волонтеров нашего фонда!

Проект «Наставничество» существует уже больше года в Москве, МО и некоторых регионах, в течение которого для 50 ребят из детских домов были найдены старшие товарищи. Фонд помогает сиротским учреждениям Тульской области уже более 6 лет, теперь и в формате проекта «Наставничество». По результатам прошлого года наставниками для детей стали 7 человек.

К каждому наставнику прикрепляется один ребенок, встречи с которым проходят регулярно — волонтеры приезжают в гости, проводят вместе с детьми свободное время, занимаются творчеством, делают уроки или совершают поездки. Кураторы и психологи оказывают непосредственную поддержку и сопровождение.

Общение со старшим другом помогает ребенку почувствовать себя нужным, стать более уверенным и самостоятельным, открыться миру и открыть мир для себя. Для наставников же эта дружба становится возможностью поделиться своими увлечениями и жизненным опытом, стать значимой частью жизни другого человека.

Возраст подопечных ребят: от 12 лет.

Занятость: не реже одного раза в неделю.

Учреждения: ГОУ Барсуковская школа-интернат, Головеньковский детский дом-интернат, ГУ ТО «Одоевский дом-интернат для престарелых и инвалидов», Тульская область.

Желающие стать добровольцем проекта «Наставничество» проходят цикл вводных семинаров и собеседование с психологом фонда.

В этом году первый семинар состоится в Туле 4 марта 2018 года по адресу: г.Тула, ул.Епифанская, д.189 (в здании ГУТО «Региональный центр «Развитие», 1 этаж). Начало в 11 часов, продолжительность около 5 часов с перерывом.

Для записи заполните анкету: https://goo.gl/forms/w3Sg6iXxK9WpGeOi1
Вопросы можно задать по почте [email protected]

Задать векторы развития районам области

Опубликовано 01 февраля 2018 10:26

Обновлено 29 апреля 2021 04:52

Управляющий Отделения ПФР по Саратовской области Александр Романов провел в Базарном Карабулаке зональное совещание «Социальная политика как вектор эффективного развития районов области». В мероприятии приняли участие представители Базарно-Карабулакского, Балтайского, Новобурасского, Воскресенского и Петровского районов. Работа проводилась на шести различных площадках, а началась со встречи с активом района.

— Сегодня нам очень важно понять: чем живет каждый район? Какие у него проблемы, и какие возможности? И найти пути решения проблем, консолидировав усилия власти трех уровней, привлекая общественность и бизнес-сообщество, — отметил Александр Романов. – На встречах мы будем обсуждать все вопросы социальной сферы, и я предлагаю не рапортовать об успехах, а сразу переходить к сути.

Сельские больницы и школы начинают испытывать кадровый голод: молодежь, окончив профильные вузы, старается закрепиться в городе. Начальник отдела образования Наталья Костина сказала, что хотя за последние три года в школы и детские сады района устроились работать 12 молодых специалистов, проблема дефицита высокопрофессиональных педагогов остается актуальной по ряду предметов: физика, математика, английский язык. Профориентационная работа ведется с вузами, выпускниками, родительской общественностью.

— А что делает муниципальная власть? – поинтересовался Александр Романов, — Чем пытается заинтересовать молодых специалистов?

Главный врач районной больницы Андрей Анисимов сообщил, что сейчас по целевому направлению в мединституте обучаются 19 выпускников района, трое из них сейчас проходят практику в районной больнице.

По мнению Александра Романова, необходимо разработать программу повышения уровня жизни района, а для решения острых проблем создать рабочую группу. Более эффективно использовать культурные, спортивные, социально значимые объекты, а к внедрению нового привлекать меценатов.

У Базарно — Карабулакского района есть опыт в этом направлении, по такому принципу в районе давно решают все серьезные вопросы и был реализован проект «Базарный Карабулак – территория здорового образа жизни», благодаря которому в районе появилось много спортивных объектов, оборудованных мест для активного отдыха жителей.

Руководитель социальной службы района Людмила Жиляева в своем выступлении сделала акцент на новшествах в социальном законодательстве, реализуемых во исполнение указов Президента. Закон вступил в силу 1 января 2018 года, и пока за ежемесячной выплатой за рождение первенца обратилась только одна семья из села Алексеевка. Александр Романов напомнил, что выплаты за рождение второго ребенка производятся из средств материнского капитала.

— Надо объяснять людям, что это дополнительные меры поддержки семей с детьми. Их получение не отменит пособия при рождении ребенка и других мер поддержки, полагающимся родителям, — подчеркнул Александр Сергеевич.

Параллельно с совещанием в районной больнице и школе №2 состоялись встречи с медицинскими и педагогическими работниками. Специалисты Отделения ПФР по Саратовской области информировали их о новациях в пенсионном законодательстве и консультировали по интересующим вопросам. В Базарно-Карабулакском техникуме агробизнеса для учащихся был проведен урок пенсионной грамотности.

В местной приемной партии «Единая Россия» Александр Романов провел прием граждан. Жители обратились с вопросом об индексации пенсии работающим пенсионерам после увольнения. Александр Сергеевич объяснил, что января 2018 года после прекращения пенсионером трудовой деятельности полный размер пенсии с учетом всех индексаций будет выплачиваться за период с 1-го числа месяца, следующего за месяцем увольнения. Это стало возможным благодаря вступлению в силу Федерального закона № 134-ФЗ «О внесении изменения в статью 26.1 Федерального закона «О страховых пенсиях»». Кроме того, Александр Романов оказал помощь погорельцам из села Алексеевка, многодетной семье из села Малые Озерки, где вышел из строя газовый котел, обещал содействие пенсионеру из села Липовка, претендующему на получение звания «Ветеран труда». Два человека пришли на прием не с просьбами, а чтобы выразить депутату благодарность. При поддержке Александра Сергеевича в селе Вязовка соорудили ледовую площадку, где с удовольствием проводят время и дети, и взрослые.

Ярким праздником для жителей района стал концерт «Пенсионный фонд – единство поколений».

Основы программирования в R

Создание матрицы

Матрицы в R можно создавать разными способами. Выбор способа зависит от того, какую матрицу мы хотим создать: пустую матрицу (чтобы потом заполнять ее нужными значениями) или матрицу, составленную из уже имеющихся значений, например, из векторов.

Для того чтобы создать пустую матрицу, нужно определить, матрицу какой размерности мы хотим. Размерность матрицы – число строк и число столбцов в ней. Создадим для начала матрицу $2 \times 3$, состоящую из нулей:

M <- matrix(0, nrow = 2, ncol = 3)
M

##      [,1] [,2] [,3]
## [1,]    0    0    0
## [2,]    0    0    0

Можем посмотреть на ее размерность:

dim(M)

## [1] 2 3

Заполнять эту матрицу другими значениями мы пока не будем – это будет интереснее делать, когда мы узнаем про циклы. А сейчас посмотрим, как собрать матрицу из “готовых” векторов.
Пусть у нас есть три вектора

x <- c(1, 2, 3, 0)
y <- c(4, 5, 6, 0)
z <- c(7, 8, 9, 0)

и мы хотим объединить их в матрицу. Векторы будут столбцами матрицы:

M_cols <- cbind(x, y, z) # c - от columns
M_cols

##      x y z
## [1,] 1 4 7
## [2,] 2 5 8
## [3,] 3 6 9
## [4,] 0 0 0

А теперь векторы будут строками матрицы:

M_rows <- rbind(x, y, z) # r - от rows
M_rows

##   [,1] [,2] [,3] [,4]
## x    1    2    3    0
## y    4    5    6    0
## z    7    8    9    0

Другой способ создавать матрицы — разбивать на строки один длинный вектор. Возьмем вектор:

long_vec <- c(1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 0, 5, 0)

Посиотрим, сколько в нем элементов:

length(long_vec)

## [1] 12

А теперь превратим вектор в матрицу из трех строк и четырех столбцов:

m1 <- matrix(long_vec, 3, 4) # получим матрицу с 3 строками и 4 столбцами
m1

##      [,1] [,2] [,3] [,4]
## [1,]    1    4    7    0
## [2,]    2    5    8    5
## [3,]    3    6    9    0

Конечно, если бы потребовали от R невозможное – матрицу, произведение числа строк и столбцов которой не равно длине вектора, из которого мы пытаемся эту матрицу создать – мы бы получили ошибку:

# m2 <- matrix(long_vec, 4, 5)

Столбцам и строкам матрицы можно дать названия. Посмотрим еще раз на матрицу m1:

m1

##      [,1] [,2] [,3] [,4]
## [1,]    1    4    7    0
## [2,]    2    5    8    5
## [3,]    3    6    9    0

А теперь дадим столбцам этом матрицы названия.

colnames(m1) <- c("A", "B", "C", "D")
m1

##      A B C D
## [1,] 1 4 7 0
## [2,] 2 5 8 5
## [3,] 3 6 9 0

А теперь назовем строки матрицы:

rownames(m1) <- c("r1", "r2", "r3")
m1

##    A B C D
## r1 1 4 7 0
## r2 2 5 8 5
## r3 3 6 9 0

Можно, конечно, присваивать названия сразу и строкам, и столбцам. Проделаем это с матрицей M_cols.

dimnames(M_cols) <- list(c("r1", "r2", "r3", "r4"), c("X", "Y", "Z")) # сначала названия строк, затем -- столбцов

О том, что такое list – поговорим чуть позже.

4.12 Vectors

Vectors in The Racket Guide представляет векторы.

Вектор — это массив фиксированной длины с доступом в постоянное время и обновление векторных слотов, пронумерованных от 0 до на единицу меньше, чем количество слотов в векторе.

Два вектора равны? если они одинаковой длины, и если значения в соответствующих слотах векторов равны равный?.

Вектор может быть изменяемым или неизменным.Когда неизменяемый вектор предоставляется такой процедуре, как vector-set !, exn: fail: возникает исключение контракта. Векторы, созданные по умолчанию reader (см. Чтение строк) неизменны. Использовать неизменный? чтобы проверить, является ли вектор неизменным.

Вектор может использоваться как однозначная последовательность (см. Последовательности). Элементы вектора служат элементами последовательности. См. Также in-vector.

Буквальный или печатный вектор начинается с # (, необязательно с число между # и (.См. Чтение векторов для информации по чтению векторы и печать векторов для информации о векторах печати.

Возвращает #t, если v — вектор, в противном случае — #f.

Возвращает изменяемый вектор со слотами размера, где все слоты инициализирован, чтобы содержать v.

Эта функция требует времени, пропорционального размеру.

Возвращает вновь выделенный изменяемый вектор с таким количеством слотов, как предусмотрено vs, где слоты инициализируются для хранения заданного vs в заказывать.

Возвращает вновь выделенный неизменяемый вектор с таким количеством слотов, как предусмотрено vs, где слоты содержат данное vs в заказывать.

Возвращает длину vec (т. Е. Количество слотов в вектор).

Эта функция требует постоянного времени.

Возвращает элемент в позиции слота vec. Первое слот находится в позиции 0, а последний слот на единицу меньше, чем (вектор длины vec).

Эта функция требует постоянного времени.

Обновляет позицию слота vec, чтобы он содержал v.

Эта функция требует постоянного времени.

Добавлен в версию 6.90.0.15 пакета base.

Операция сравнения и задания векторов.Смотрите box-cas !.

Добавлен в версию 6.11.0.2 пакета base.

Возвращает список той же длины и элементов, что и vec.

Эта функция требует времени, пропорционального размеру vec.

Возвращает изменяемый вектор той же длины и элементов, что и lst.

Эта функция требует времени, пропорционального длине lst.

Возвращает неизменяемый вектор той же длины и элементов, что и vec. Если vec сам по себе неизменяемый, то он возвращается как результат.

Эта функция требует времени, пропорционального размеру vec, когда vec изменчив.

Изменяет все слоты vec, чтобы они содержали v.

Эта функция требует времени, пропорционального размеру vec.

Изменяет элементы dest, начиная с позиции dest-start соответствует элементам в src из src-start (включительно) до src-end (исключая). В векторы dest и src могут быть одним и тем же вектором, а в в этом случае целевой регион может перекрываться с исходным регионом; целевые элементы после копии соответствуют исходным элементам от до копии.Если какой-либо из dest-start, src-start или src-end находятся вне допустимого диапазона (с учетом учитывать размеры векторов, а также источник и место назначения регионов) возникает исключение exn: fail: contract.

Эта функция занимает время, пропорциональное (- src-end src-start).

Примеры:

Возвращает end-pos — значения start-pos, которые элементы vec от start-pos (включительно) до end-pos (исключительный). Если start-pos или end-pos больше, чем (vector-length vec), или если конечная позиция меньше, чем начальная позиция, exn: fail: возникает исключение контракта.

Эта функция требует времени, пропорционального размеру vec.

Создает вектор из n элементов, применяя процедуру к целые числа от 0 до (sub1 n) по порядку. Если vec — это результирующий вектор, затем (vector-ref vec i) — значение, созданное (proc i).

Пример:

4.12.1 Дополнительные векторные функции

Возвращает #t, если v пусто (т.е. его длина равна 0), в противном случае — #f.

Добавлен в версию 7.4.0.4 пакета base.

Обновляет pos каждого слота vec, чтобы он содержал каждый v. Обновление происходит слева, поэтому более поздние обновления перезаписывают более ранние обновления.

Применяет proc к элементам vecs из первые элементы до последнего. Аргумент proc должен принимать такое же количество аргументов, как и количество предоставленных vecs, и все vecs должны иметь одинаковое количество элементов. В результат — это свежий вектор, содержащий каждый результат процедуры в заказывать.

Пример:

Аналогично векторной карте, но результат процедуры вставлен в первое vec по индексу, которое аргументы proc были взяты из.Результат — первый vec.

Примеры:

Создает новый вектор, содержащий все элементов данных векторов по порядку.

Пример:

Возвращает новый вектор, элементы которого являются первыми элементами pos vec. Если vec меньше, чем pos, то возникает исключение exn: fail: contract.

Пример:

Возвращает новый вектор, элементы которого являются последними элементами pos в vec. Если vec меньше, чем pos, то возникает исключение exn: fail: contract.

Пример:

Возвращает свежий вектор, элементы которого являются элементами vec после первых элементов pos. Если у vec меньше чем элементы pos, то возникает исключение exn: fail: contract.

Пример:

Возвращает новый вектор, элементы которого являются префиксом vec, опускает свой длинный хвост. Если у vec меньше чем элементы pos, то возникает исключение exn: fail: contract.

Примеры:

Возвращает тот же результат, что и

(values (vector-take vec pos) (vector-drop vec pos))

, за исключением того, что это может быть быстрее.

Пример:

Возвращает тот же результат, что и

(values (vector-take-right vec pos) (vector-drop-right vec pos))

, за исключением того, что это может быть быстрее.

Пример:

Создает новый вектор размера (- конец начала) со всеми элементы vec от начала (включительно) до конец (исключительный).

Примеры:

Возвращает свежий вектор с элементами vec, для которого pred дает истинное значение. Предварительная процедура применяется к каждому элементу от первого до последнего.

Пример:

Подобно векторному фильтру, но значение предиката перевернуто: результатом является вектор всех элементов, для которых пред возвращает #f.

Пример:

Возвращает количество элементов вектора … (взятых в parallel), на котором proc не оценивается как #f.

Примеры:

Возвращает первый элемент непустого вектора vec, который минимизирует результат прока.

Примеры:

Возвращает первый элемент непустого вектора vec, который максимизирует результат прока.

Примеры:

Находит первый равный элемент vec? к v. Если такой элемент существует, индекс этого элемента в vec возвращается. В противном случае результат будет #f.

Примеры:

Как sort, но работает с векторами; а свежий вектор длины (- конец начала) равен возвращается, содержащий элементы из индексов от начала (включительно) до конца (исключая) vec, но в отсортированном порядке (т.

е. vec без изменений). Этот сорт стабилен (т. Е. Порядок «равных» элементы сохранены).

Примеры:

Добавлено в версии 6.6.0.5 пакета base.

Аналогично векторной сортировке, но обновляет индексы от начала (включительно) до конца (исключая) of vec, отсортировав их по критерию «меньше чем?» процедура.

Примеры:

Добавлено в версии 6.6.0.5 пакета base.

[Алгоритмы] Временная сложность вектора, множества и карты

ключевых слов: C ++, временная сложность, вектор, набор и карта

Временная сложность find () в std :: map

std :: map и std :: set реализованы поставщиками компиляторов с использованием хорошо сбалансированных двоичных деревьев поиска (например,грамм. красно-черное дерево, АВЛ дерево).

Как правильно указал Дэвид, find займет время O (log n), где n — количество элементов в контейнере.

Но это с примитивными типами данных, такими как int , long , char , double и т. Д., А не со строками.

Если std: string, скажем, размера ‘m’ используется в качестве ключа, обход высоты сбалансированного двоичного дерева поиска потребует log n сравнений данного ключа с записью дерева.

Когда std :: string является ключом std :: map или std :: set , find и insert операции будут стоить O (m log n), где m — длина заданная строка, которую нужно найти.

Цит. Из:
Временная сложность find () в std :: map?
https://stackoverflow.com/questions/9961742/time-complexity-of-find-in-stdmap

Временная сложность find () в std :: vector, std :: map и std :: unordered_map

Сложность поиска элемента в std :: vector с помощью линейного поиска составляет O (N).Это O (log N) для std :: map и O (1) для std :: unordered_map. Однако обозначение сложности игнорирует постоянные множители. Различные контейнеры имеют разные накладные расходы на обход для поиска элемента. Например, ветвление узла во время обхода дерева в std :: set и сложность хеширования в std :: unordered_set считаются постоянными накладными расходами по сложности. С другой стороны, хотя сложность std :: vector является линейной, адреса памяти элементов в std :: vector являются смежными, что означает более быстрый доступ к элементам по порядку.

Цитируется из:
Поиск: вектор, набор и unordered_set
https://medium.com/@gx578007/searching-vector-set-and-unordered-set-6649d1aa7752

Номер ссылки

Поиск: вектор, набор и неупорядоченный_набор
https://medium.com/@gx578007/searching-vector-set-and-unordered-set-6649d1aa7752

Сложность времени
https://en.wikipedia.org/wiki/Time_complexity

Файл: Comparison computational complex.svg
https://en.wikipedia.org/wiki/File:Comparison_computational_complexity.svg

Возможно, именно это имели в виду истории, когда называли кого-то больным сердцем. Ваше сердце, ваш желудок и все ваши внутренности казались пустыми, пустыми и ноющими. - Габриэль Гарсиа Маркес,

[ВИДЕО] Вектор и соединение: Как настроить вектор

В этом разделе часто задаваемых вопросов узнайте, как настроить Vector, как Vector подключается к Интернету и где найти шаги по устранению неполадок, если у вас возникнут какие-либо проблемы с подключением.
Краткий обзор настройки
Убедитесь, что вы приобрели подписку. Если вы являетесь Kickstarter или ранним инвестором, вы можете использовать существующую лицензию, отправив нам электронное письмо по адресу [email protected].
Приложение Vector находит Vector и подключается к нему через сигнал, который он излучает (Vector будет , а не , который будет указан в настройках WiFi или Bluetooth вашего смарт-устройства)
Приложение затем позволяет Vector сканировать доступные домашние сети Wi-Fi
После того, как Вектор подключился к предпочтительной сети Wi-Fi, он подключается к Интернету для доступа к серверам Digital Dream Labs
После успешного подключения Vector загрузит последнюю версию прошивки с сервера
Digital Dream Labs.
Vector перезагрузится и подключится к вашему устройству через Wi-Fi для завершения настройки
Требования для настройки Vector
-совместимое устройство для запуска приложения Vector — требуется для установки
Учетная запись Vector — требуется действующий адрес электронной почты и активация учетной записи
802.11n сеть Wi-Fi 2,4 ГГц, подключенная к Интернету через точку доступа Wi-Fi (маршрутизатор NAT)
Источник питания USB (адаптер, порт USB, внешний аккумулятор и т. Д.) С мин. 5 В = 1 А выход
Настройка Vector
PDF-версию Краткого руководства по началу работы с Vector (QSG) см. Здесь
Распакуйте Вектора, его зарядное устройство и его Куб на чистой, хорошо освещенной поверхности или поместите Вектора в его Пространство
Загрузите приложение Vector, откройте его и следуйте инструкциям в приложении. Приложение разработано, чтобы помочь вам выполнить шаги, но мы перечислили их краткое изложение ниже:
Пароль требует мин. 8 символов, минимум 1 строчная буква, минимум 1 заглавная буква, минимум 1 цифра
Примечание: пароль не позволяет использовать специальные символы
Vector поддерживает только английский язык: выберите американский, британский или австралийский английский
Подключите USB-кабель зарядного устройства Vector к совместимому источнику питания и поместите Vector на его зарядное устройство
Введите дату своего рождения в формате «месяц-дата-год».Примечание: вам должно быть 18+, чтобы иметь учетную запись Vector
Введите свой адрес электронной почты, чтобы создать новую учетную запись Vector, или, если у вас есть учетная запись OVERDRIVE, или вы создали учетную запись на Anki.com, войдите в систему под своим существующим именем пользователя (а не с адресом электронной почты)
Создать пароль
В зависимости от вашего региона выберите, хотите ли вы разрешить Digital Dream Labs анонимный сбор данных об использовании для улучшения услуг.
Выберите, если вы хотите подписаться на информационный бюллетень
Найдите в своем почтовом ящике письмо для активации и нажмите «Активировать учетную запись» (проверьте папку «Спам», если вы его не видите, либо повторно отправьте письмо из приложения Vector.Обратите внимание, что если вы повторно отправите письмо для активации, вам нужно щелкнуть ссылку в новейшем электронном письме , чтобы избежать отправки на 404)
Убедитесь, что на вашем устройстве включены Bluetooth и Wi-Fi
Приложение теперь будет искать Вектор, чтобы подключиться к нему по беспроводной сети
Когда приложение найдет Vector, нажмите «Подключить»
дважды нажмите кнопку «Назад» вектора (сильно нажмите на верхнюю часть светодиодной ленты — вы услышите щелчок, см. Видео ниже) и введите 6-значный PIN-код, отображаемый на его экране, в приложение
После беспроводного подключения приложения Vector к роботу он позволит вам выбрать домашнюю точку доступа WiFi и подключиться к ней
Если вы хотите подключить Vector к скрытой сети Wi-Fi, нажмите «Не видите вашу сеть Wi-Fi?» и используйте диалоговое окно «Введите SSID для вашей сети WiFi»
После того, как соединение WiFi будет установлено, Вектор запросит разрешение на загрузку последней версии своей операционной системы (ОС)
Если обновление прошло успешно, робот перезагрузится, и приложение снова подключится — Вектор отобразит мигающую букву «V на значке телефона».
Теперь установите настройки робота для его «местоположения» (введите его вручную в поле), часового пояса, единиц измерения температуры и расстояния (метрических, британских или смешанных) и, наконец, отображения часов — они важны для правильной работы Vector.
Нажмите «Пуск», чтобы завершить настройку, и вы перейдете к руководству в приложении — мы предлагаем вам изучить приложение, чтобы познакомиться со своим новым компаньоном!

Если у вас возникли проблемы при настройке Vector, см. в этом FAQ.
Все еще нужна помощь? Свяжитесь с нами Свяжитесь с нами
Последнее обновление: 8 января 2021 г.
Дополнение: EasyClone-MarkerFree Vector Set
Наборы
EasyClone-Marker — бесплатный векторный набор
Депозитная лаборатория: Ирина Бородина
Набор EasyClone-MarkerFree Vector Set представляет собой полный набор для введения генов в 11 заранее определенных хромосомных локусов EasyClone. В комплект входит один экспрессирующий вектор Cas9, 11 интегративных векторов (по одному для каждого локуса), 14 вспомогательных векторов гРНК (11 для нацеливания на один сайт и 3 для нацеливания на тройной сайт), один пустой вектор для вставки кассет экспрессии гРНК и 2 примера вектора, содержащие двунаправленные промоторы.
Этот набор будет отправлен в виде запасов бактериального глицерина в формате 96-луночного планшета.
Оригинальная публикация
EasyClone-MarkerFree: векторный набор инструментов для безмаркерной интеграции генов в Saccharomyces cerevisiae через CRISPR-Cas9. Jessop-Fabre MM, Jakočiūnas T, Stovicek V, Dai Z, Jensen MK, Keasling JD, Borodina I. Biotechnol J. 2016 Aug 11 .; DOI: 10.1002 / biot.201600147. PubMed PMID: 27166612.
Описание
Набор EasyClone-MarkerFree Vector Set — это полный набор для введения генов в 11 заранее определенных хромосомных локусов EasyClone. Они были подтверждены на стабильность и высокую экспрессию. Каждый из этих сайтов расположен между основными генами и, таким образом, не склонен выходить за пределы хромосомы.Каждый сайт может экспрессировать до двух генов в сочетании с двунаправленным промотором (один на смысловой цепи и один на антисмысловой цепи).
В набор входит экспрессирующий вектор Cas9, 11 одноцентровых гРНК и 3 трехсайтовых гРНК, которые направляют Cas9 на разрезание хромосомы в указанных хромосомных местах. Эти трехсайтовые гРНК направляют Cas9 разрезать три отдельных локуса, что приводит к потенциальной вставке 6 генов на трансформацию (2 на локус).Двухцепочечный разрыв (и) затем репарируется клеткой-хозяином с использованием нативного механизма гомологичной рекомбинации, который включает вектор (ы) EasyClone-MarkerFree в целевые локусы посредством двойного кроссинговера. Эта система очень эффективна (90% правильных клонов с одной вставкой, 60-70% с тройными вставками), поэтому нет необходимости вставлять маркеры в хромосому хозяина. Это значительно ускоряет развитие штаммов.
Комплект документации
EasyClone-MarkerFree_manual.pdf (826,4 КБ)
Как цитировать этот комплект
Эти плазмиды созданы вашими коллегами. Пожалуйста, подтвердите имя главного исследователя, процитируйте статью, в которой они были созданы, и включите Addgene в Материалы и методы ваших будущих публикаций.
Для получения информации о ваших материалах и методах:
«EasyClone-MarkerFree Vector Set — подарок Ирины Бородиной (аддгенический набор № 1000000098).”
Для справки:
EasyClone-MarkerFree: векторный набор инструментов для безмаркерной интеграции генов в Saccharomyces cerevisiae через CRISPR-Cas9. Jessop-Fabre MM, Jakočiūnas T, Stovicek V, Dai Z, Jensen MK, Keasling JD, Borodina I.PubMed PMID: 27166612
EasyClone-MarkerFree Векторный набор — # 1000000098
Цветной ключ сопротивления
Каждый кружок соответствует определенной устойчивости к антибиотикам в лунках планшета с набором карт.
Опись
Таблица всех плазмид в наборе с возможностью поиска и сортировки. Колонка колодца перечисляет расположение лунки плазмиды на планшете. Столбец плазмиды ссылается на отдельную веб-страницу плазмиды.
Комплект пластины Карта
Карта 96-луночного планшета для размещения плазмид. При наведении курсора на лунку отображается имя плазмиды, а при нажатии на лунку открывается страница плазмиды.
Данные рассчитаны на 28. 04.2021 Карта тарелки комплекта
— # 1000000098
Пластина No 1
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
A
B
С
D
E
Ф.
G
H
Контент заблокирован, вам может потребоваться отключить блокировку рекламы.
Набор векторных клонирующих шлюзов для высокопроизводительного функционального анализа генов растений
Plant Physiol. 2003 Oct; 133 (2): 462–469.
Институт биологии растений и Цюрихско-Базельский научный центр растений, Цюрихский университет, Цюрихштрассе 107, CH-8008 Цюрих, Швейцария
Поступила в редакцию 2 июня 2003 г .; Пересмотрено 17 июня 2003 г .; Принята в печать 25 июня 2003 г.
Copyright © 2003, Американское общество биологов растений. Эта статья цитируется в других статьях в PMC.
Дополнительные материалы
Дополнительные данные
GUID: D6CA5E0E-C89F-4152-A51B-F5677697DE3E
GUID: 4B667DAF-FFA6-4DBC-A193-F67A8EA1706A
Abstract
Текущая задача, теперь, когда два генома растений секвенированы, состоит в том, чтобы назначить функцию возрастающему числу предсказанных генов. У Arabidopsis примерно 55% генов могут быть отнесены к предполагаемой функции, однако менее 8% из них получили функцию в результате прямых экспериментальных данных. Чтобы идентифицировать эти функции, многие гены должны будут подвергнуться всестороннему анализу, который будет включать продукцию химерных трансгенов для конститутивной или индуцибельной эктопической экспрессии, для антисмысловой или доминантно-негативной экспрессии, для исследований субклеточной локализации, для анализа промоторов и для исследований комплементации генов. . Получению таких трансгенов часто мешает трудоемкая традиционная технология клонирования, основанная на рестрикционном переваривании и лигировании. Чтобы предоставить инструменты для высокопроизводительного анализа генов, мы создали шлюз-совместимый Agrobacterium sp.бинарная векторная система, которая обеспечивает быстрое и надежное клонирование ДНК. Этот набор векторов находится в свободном доступе для некоммерческих целей и может использоваться для эктопической экспрессии генов конститутивно или индуцибельно. Векторы можно использовать для экспрессии слитых белков с зеленым флуоресцентным белком Aequorea victoria и с белком β-глюкуронидазы, чтобы можно было идентифицировать субклеточную локализацию белка. Их также можно использовать для создания конструкций промотор-репортер и для облегчения эффективного клонирования фрагментов геномной ДНК для экспериментов по комплементации.Все векторы были получены из векторов клонирования Т-ДНК pCambia, за исключением химически индуцируемого вектора, для трансформации, опосредованной Agrobacterium sp., Широкого ряда видов растений.
Геномный анализ растений в последние годы быстро продвинулся вперед благодаря секвенированию геномов арабидопсиса и риса. Геном арабидопсиса был первым из этих эталонных растительных организмов, который был секвенирован, и показал, что почти 30 000 генов — это все, что необходимо для функционирования растения (Arabidopsis Genome Initiative, 2000).Однако в настоящее время задача состоит в том, чтобы определить, как эти гены функционируют на клеточном и организменном уровнях и как генетические пути развиваются, чтобы произвести разнообразие, которое позволило растениям воспроизводить и колонизировать различные среды обитания. К этому функциональному анализу можно подойти разными способами, большинство из которых полагаются на экспрессию трансгенов для управления биологическими процессами в трансгенных растениях. Эти подходы включают фенотипические исследования, проведенные путем создания мутантов с повышением или потерей функции.Усиление функции может быть достигнуто путем помещения гена под транскрипционный контроль конститутивного промотора (Wilson et al., 1996; Schaffer et al., 1998). Такая эктопическая экспрессия гена может обеспечить фенотип, который помогает выяснить его функцию. Например, эктопическая экспрессия гена, который вызывает переключение клеточной судьбы, помогает выяснить роль, которую этот ген может играть в развитии.
Конститутивная неправильная экспрессия генов, хотя и полезна в первом случае, может, однако, маскировать тканеспецифические эффекты или может привести к летальности или бесплодию.Чтобы преодолеть эти проблемы, было использовано несколько методов, которые контролируют экспрессию во времени. Такие методы включают регуляцию экспрессии генов с использованием промотора теплового шока (Holtorf et al., 1995) или с использованием химически индуцированной системы экспрессии (Gatz et al., 1992; Weinmann et al., 1994; Böhner et al., 1999; Martinez et al., al., 1999; Bruce et al., 2000; Zuo et al., 2000). Эти подходы позволяют изучать активность гена в определенный момент жизненного цикла растения. Напротив, мутанты с потерей функции могут быть получены с использованием антисмысловых конструкций или доминантно-негативных конструкций, а фенотип растений, проанализированный в отсутствие активности этого гена, снова может указывать на его функциональную роль.Исследования экспрессии генов, которые идентифицируют паттерн экспрессии гена, являются дополнительными подходами, которые помогают выяснить функцию гена (Gawantka et al., 1998). В этом типе анализа могут быть обнаружены свидетельства вероятных пространственных и временных областей экспрессии гена. Конструкции промотор-репортер часто используются для подтверждения функциональной роли генов путем определения вероятных пространственных и временных доменов экспрессии гена (Batni et al. , 1996; Curtis et al., 1997).
Еще одним показательным подходом к изучению функции генов является изучение субклеточной локализации соответствующего белка. Здесь часто проводятся исследования с использованием конструкций слияния химерных генов с репортерными генами. Расположение репортерного белка в субклеточном компартменте, как указано неизвестным слитым белком, часто предоставляет дополнительные подтверждающие доказательства функции гена (von Arnim et al., 1997; Mayer et al., 1998).
Хотя все эти подходы являются эффективными методами определения функции генов, производство конструкций является трудоемким и часто затрудняется из-за неправильного расположения сайтов рестрикции, которые делают производство трансгенных конструкций «узким местом» в функциональном анализе генов растений.Это особенно верно при клонировании больших фрагментов геномной ДНК или создании большого количества клонов в проекте функциональной геномики.
Здесь мы описываем полный набор растительных векторов, который направлен на устранение этой «бутылочной горловины», обеспечивая надежный и эффективный метод быстрого направленного клонирования генов и их промоторов. Этот набор векторов находится в свободном доступе для некоммерческих целей и представляет собой комплексный набор инструментов для молекулярной генетики растений, который позволяет выполнять множество генетических манипуляций от субклеточной локализации до индуцибельной эктопической экспрессии генов.Эти векторы облегчают высокопроизводительный анализ ДНК и характеристику продуктов генов за счет включения стоп-кодонов (во всех трех рамках считывания), прилегающих к 3′-концу кассеты Gateway (Hartley et al., 2000) (где необходимо), так что гены, лишенные нативный стоп-кодон, фланкированный сайтами рекомбинации att , может быть свободно перенесен во все векторы в серии, независимо от того, предполагается ли неправильная экспрессия гена или слияние с β-глюкуронидазой (GUS) или зеленым флуоресцентным белком (GFP) .Эта возможность недоступна в описанных в настоящее время растительных векторах Gateway (Karimi et al., 2002), равно как и средство для индукции экспрессии генов.
В растениях субклеточная локализация с использованием слитых белков GUS или GFP широко применяется для исследования нацеливания на белок. Однако часто ограничения в производстве таких слитых белков заключаются в адаптации гена к вектору слияния GUS или GFP. Преимущество использования этого набора векторов заключается в том, что любой ген, за исключением его природного стоп-кодона, клонированный в донорский вектор (и, таким образом, фланкированный сайтами attP ), может быть консервативно перенесен за один этап в правильной ориентации с высокой эффективностью. в любой вектор в серии, созданной во всех трех рамках считывания.Еще одним преимуществом является то, что эти векторы содержат сайты распознавания рестрикции длиной 8 пар оснований для Asc I и Pac I. Эти сайты фланкируют кассеты рекомбинации att , так что положительная идентификация новых рекомбинационных клонов, в которых новая ДНК заменила кассета рекомбинации att может быть получена эффективно.
РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ
Мы сконструировали множество совместимых со шлюзом бинарных векторов Т-ДНК-адресатов для широкого спектра различных применений в растениях (). Подробную информацию об этих векторах можно найти на веб-сайте (http://www.unizh.ch/botinst/Devo_Website/curtisvector/), где представлены полные последовательности ДНК и рестрикционные карты всех конструкций. Веб-сайт будет обновляться путем добавления новых конструкций и соответствующей информации по мере их появления. За исключением pMDC7, костяк всех Gateway-совместимых векторов-получателей происходит из серии бинарных векторов pCambia для трансформации растений, опосредованной Agrobacterium sp. (http: // www.cambia.org/). Вектор pMDC7 происходит из PER8 (Zuo et al., 2000). Сайт рекомбинации Gateway для введения интересующего фрагмента ДНК был помещен у правого края Т-ДНК в векторах pCambia. Большинство описанных векторов-мишеней Т-ДНК содержат селектируемый растительным маркерный ген гигромицинфосфотрансферазы. Этот селектируемый маркер был выбран таким образом, чтобы эти векторы были совместимы с большим количеством линий вставок, устойчивых к канамицину, например вставками Ds (http: // genetrap. cshl.org/ и http://enhancertraps.bio.upenn.edu/EnhancerTraps.html), вставки Т-ДНК SALK (http://signal.salk.edu/tabout.html) или лаборатория по уничтожению арабидопсиса в Мэдисоне. (http://www.biotech.wisc.edu/Arabidopsis/) или устойчивые к гербицидам, например линии SLAT (http://nasc.nott.ac.uk/info/slat_info1.html; Tissier et al. , 1999) или линий Institut National de la Recherche Agronomique, которые устойчивы как к канамицину, так и к гербицидам (http://www.Arabidopsis.org/abrc/inra.html; Bechtold et al., 1993). Однако векторы для комплементации содержат либо неомицинфосфотрансферазу II, либо гигромицинфосфотрансферазу, либо ген биалафосацетилтрансферазы, которые придают устойчивость к канамицину, гигромицину и глюфосинату аммония соответственно. Все три селектируемых маркера находятся под регуляцией транскрипции промотора 35S вируса мозаики цветной капусты (CaMV) и терминатора nos (Odell et al., 1985) и примыкают к левой границе Т-ДНК. Полное описание конструкции вектора см. В дополнительных материалах.
Схема, иллюстрирующая структуру клонирующих векторов, совместимых со шлюзом, показывающая сайты рекомбинации, фланкированные сайтами распознавания восьми нуклеотидов Asc I и Pac I. A, pMDC32, вектор конститутивной экспрессии, несущий двойной промотор 35S, и pMDC30, вектор, индуцируемый тепловым шоком; B, pMDC7, полученный из PER8, вектора, индуцируемого эстрогеном. C, pMDC45, pMDC44 и pMDC43 для конструирования слитых GFP6 с С-концом. D, pMDC83, pMDC84 и pMDC85 для конструирования N-концевых слитых с GFP6his-метками.E, pMDC139, pMDC140 и pMDC141 для конструирования N-концевых слияний GUS. F, pMDC107, pMDC111 и pMDC110, для конструирования векторов промотор-репортер (слияние нативного промотор-ген) GFP6. G, pMDC162, pMDC163 и pMDC164, для конструирования GUS-векторов промотор-репортер (слияние нативного промотор-ген). H, pMDC99, pMDC100 и pMDC123 для комплементации мутантов геномными фрагментами.
Целевые векторы для конститутивной эктопической экспрессии генов
Чтобы способствовать производству конструкций для эктопической экспрессии генов в растениях, Gateway-кассету B (см. ) Помещали рядом с двойным промотором 35S CaMV в целевом векторе pMDC32 ().Этот промотор был выбран потому, что он очень активен в большинстве трансгенных растительных клеток. Ген uidA (Jefferson et al., 1987) из исходного клона вставляли в вектор-приемник pMDC32 для получения экспрессионного клона. Поколения T ₀ и T ₁ Arabidopsis экотипа Landsberg erecta , трансформированные этим экспрессирующим клоном, тестировали для подтверждения того, что конструкция, совместимая с Gateway, активна в planta. Эти трансгенные линии растений показали сильную конститутивную активность GUS во всех ожидаемых типах тканей растений, связанных с экспрессией промотора 35S CaMV (Odell et al., 1985). Эти растения также продемонстрировали, что сайты рекомбинации att не ингибируют активность трансгена и не препятствуют активности энхансера (см. Дополнительные данные). Этот вектор-адресат может, помимо эктопической экспрессии, использоваться для облегчения быстрого конструирования клонов антисмысловой экспрессии, хотя это последнее применение не тестировалось.
Нуклеотидная последовательность рядом с каждой кассетой Gateway, показывающая рамку считывания для слияний с GFP (a и b) и GUS (c).Эти последовательности также показывают стоп-кодоны в векторах, где за сайтом attR2 следует сайт Pac I, но не в векторах, где за сайтом attR2 следует сайт Asc I.
Целевые векторы для индуцибельной экспрессии генов
Теплоиндуцируемый вектор
Хотя конститутивная эктопическая экспрессия генов является мощным инструментом для функциональных исследований генов, полученная повсеместная экспрессия может привести к летальному исходу или может маскировать тканеспецифические эффекты.Поэтому мы создали конструкцию шлюза, вызывающую тепловой шок. Кассету Gateway B помещали ниже промотора теплового шока (фрагмент промотора Gmhsp17.3B из плазмиды SHS3252) в векторе-приемнике pMDC30 (). Опять же, ген uidA из исходного клона использовали с вектором-приемником pMDC30 для получения экспрессионного клона. Поколения T ₀ и T ₁ трансформантов Arabidopsis Landsberg erecta тестировали, чтобы подтвердить, что конструкция, совместимая с Gateway, индуцируется нагреванием у planta (см. Дополнительные данные).У этих растений трансген сильно индуцируется во вновь делящихся клетках, особенно в развивающихся листьях, а также в кончиках первичных и боковых корней. Контрольные растения не проявляли экспрессии в отсутствие тепловой обработки. Индукция активности гена тепловым шоком является эффективным методом обеспечения временного контроля эктопической экспрессии трансгена, однако индукционный физический стресс при 37 ° C может вызвать экспрессию других генов в растении, маскируя эффекты исследуемого гена.В наших руках никаких явных пагубных последствий для развития не наблюдалось.
Вектор, индуцируемый эстрогеном
Альтернативой индукции теплового шока является использование химической индукции. Эстроген-индуцируемый вектор экспрессии эктопического гена, PER8, был описан Zuo et al. (2000). Эта система демонстрирует эффективную индукцию без токсического воздействия на трансгенные растения. Вектор PER8 был любезно предоставлен нам профессором Нам-Хай Чуа и был сделан Gateway-совместимым с использованием кассеты B для создания вектора назначения pMDC7 ().Репортерный ген uidA встраивали ниже связывающего домена lexA и использовали для трансформации растений Arabidopsis Landsberg erecta . Трансформанты поколения T ₀, T ₁ и T ₂ были протестированы для подтверждения того, что сайты рекомбинации att не ингибируют индуцируемую эстрадиолом экспрессию репортерного гена in vivo (см. Дополнительные данные). У этих растений трансген сильно индуцируется повсеместно, особенно в корнях, которые находились в прямом контакте с индуктором в среде.Контрольные растения не проявляли экспрессии в отсутствие обработки эстрадиолом.
кДНК WUSCHEL была использована для подтверждения того, что ген без своего природного стоп-кодона при вставке в эти векторы будет экспрессироваться без вмешательства дополнительных нуклеотидов на 3′-конце, которые включают сайт рекомбинации att и вектор. последовательность перед стоп-кодоном инфрамы. WUSCHEL был выбран в сочетании с модифицированным вектором PER8 (pMDC7), потому что экспрессия этого гена после индукции 17-β-эстрадиолом была хорошо охарактеризована (Zuo et al., 2002). кДНК WUSCHEL была амплифицирована из плазмиды A1-A (Mayer, 1998; подарок Thomas Laux) без ее природного стоп-кодона. Этот амплифицированный продукт использовали для получения клона Entry. КДНК WUSCHEL была вставлена ниже сайта связывания lexA в pMDC7. В этом векторе кДНК WUSCHEL полагается на один из стоп-кодонов в векторе, чтобы обеспечить остановку трансляции. Теперь ген имеет 36 дополнительных нуклеотидов, исключая стоп-кодон на его 3′-конце, кодирующий 12 дополнительных аминокислот.T _{1 Трансформанты Arabidopsis Landsberg erecta поколения} были протестированы для подтверждения того, что эти дополнительные нуклеотиды не изменяли индуцируемую эстрадиолом экспрессию WUSCHEL in vivo, которая была ранее описана Zuo et al. (2002;). У этих растений образование соматических зародышей, не зависящих от гормонов растений, наблюдалось только в присутствии индуктора, что подтверждает, что включение этих дополнительных нуклеотидов и использование стоп-кодона в векторной последовательности не оказывает отрицательного воздействия на этот случайно выбранный ген.Контрольные растения не проявляли экспрессии в отсутствие обработки эстрадиолом.
17-β-Эстрадиол индуцировал экспрессию WUSCHEL (a-c) в 31-дневных проростках трех независимых трансформантов, показывающих прорастающие соматические зародыши, растущие на концах первичных и боковых корней. Неиндуцированные проростки не показывают развития соматических зародышей (данные не показаны). Тот же самый ген WUSCHEL из того же начального клона использовали для C- и N-концевых слияний с GFP и N-концевых слияний с GUS.d, f и h показывают изображения светового микроскопа, а e и g показывают изображения флуоресцентного микроскопа. е, изображение под флуоресцентным микроскопом экспрессии pMDC114 в подвергнутых бомбардировке эпидермальных клетках лука (кДНК WUSCHEL , слитая с С-концом GFP, в pMDC43). g, изображение под флуоресцентным микроскопом экспрессии pMDC116 в подвергнутых бомбардировке эпидермальных клетках лука (кДНК WUSCHEL , слитая с N-концом GFP, в pMDC84). h, изображение под световым микроскопом экспрессии pMDC153 в подвергнутых бомбардировке эпидермальных луковых клетках (кДНК WUSCHEL , слитая с N-концом GUS, в pMDC141).Все показывают, что белок-маркер был локализован в ядре.
Векторы-адресаты для анализа субклеточной локализации белков
Для исследования субклеточной локализации конкретных белков была сконструирована дополнительная серия векторов-адресатов Т-ДНК, чтобы обеспечить слияние C- или N-концевых белков с GFP или GUS.
Векторы pMDC43, pMDC44 и pMDC45 были получены для C-концевых слияний GFP (), а векторы pMDC83, pMDC84 и pMDC85 были получены для N-концевых слияний ().Эти векторы обеспечивают кассеты Gateway в трех рамках считывания (). Совместимые со шлюзом N-концевые слияния с GUS также могут быть получены с использованием векторов pMDC139, pMDC140 и pMDC141 (), опять же в трех рамках считывания ().
Чтобы подтвердить, что эти векторы подходят для изучения субклеточной локализации растительных белков, мы создали слияния между белком WUSCHEL, который, как было показано ранее, является ядерной мишенью (Mayer et al., 1998), и белками GFP6 или GUS. Чтобы проиллюстрировать универсальность этих векторов, тот же самый начальный клон WUSCHEL (описанный выше, содержащий ген WUSCHEL без его природного стоп-кодона) был использован для создания слияния GFP и GUS с WUSCHEL.
Эти векторы использовали в экспериментах по биолистической бомбардировке эпидермальных клеток лука (Varagona et al., 1992), а субклеточную локализацию слитых белков исследовали с помощью световой (GUS) и флуоресцентной (GFP) микроскопии. Результаты показали, что белки GFP и GUS были нацелены на ядро при слиянии с белком WUSCHEL (). Таким образом, сайты рекомбинации att не влияют на способность WUSCHEL управлять субклеточной локализацией белков GUS или GFP.
Конструкции промотор-репортер (или гибридный промотор-ген)
Для анализа промотор-репортер с GFP6 были сконструированы векторы pMDC107, pMDC110 и pMDC111 (). Эти конструкции были получены с кассетами Gateway во всех трех рамках считывания, так что, помимо анализа промотора, слияния GFP6-гена могли быть сконструированы таким образом, чтобы слитый продукт находился под транскрипционным контролем нативного промотора гена. Аналогично, векторы pMDC162, pMDC163 и pMDC164 были сконструированы для анализа промотор-репортер с помощью GUS.Эти конструкции были снова созданы во всех трех рамках считывания для облегчения слияния GUS-гена для исследований субклеточной локализации с использованием соответствующего гена с его нативным промотором (). Для проверки функции этих векторов промотор 35S амплифицировали из плазмиды pCambia 3300 (данные не показаны) так, чтобы он был фланкирован сайтами attB1 и attB2 . Этот амплифицированный продукт использовали для получения клона входа в 35S-промотор (конструкция доступна, данные не показаны). Клон входа 35S-промотора использовали для создания клона экспрессии GUS (конструкция доступна; данные не показаны). Растения, трансформированные этой конструкцией, показали конститутивную экспрессию GUS в тканях трансгенных растений, что согласуется с паттерном экспрессии промотора 35S (см. Дополнительные данные).
Конструкции для комплементационного анализа линий мутантных растений
Для анализа комплементации в мутантных фонах можно использовать целевые векторы Т-ДНК pMDC99, pMDC100 и pMDC123 для быстрого клонирования больших фрагментов. Эти три вектора содержат кассету С1 шлюза и отличаются друг от друга только маркерами селекции растений, которые они содержат.Вектор pMDC99 придает устойчивость к гигромицину, pMDC100 придает устойчивость к канамицину, а pMDC123 придает устойчивость к BASTA. Фрагменты геномной ДНК Arabidopsis размером до 12 т.п.н. были успешно клонированы между сайтами рекомбинации att (Норберт Хак, личное сообщение) с использованием Escherichia coli DH5α. Возможно клонирование более крупных фрагментов с использованием бактериальных штаммов, таких как Stbl2 (Invitrogen, Carlsbad, CA), которые стабилизируют большие геномные фрагменты.
Таким образом, мы создали новый набор совместимых со шлюзом векторов экспрессии растений, которые позволяют эффективно конструировать трансгены для высокопроизводительного анализа ДНК и характеристики генных продуктов.Эти векторы обеспечивают надежный метод клонирования, который сводит обычный многоступенчатый подход к клонированию до одноэтапного подхода. Этот одноэтапный подход является общим для всех векторов в серии, поэтому исследуемый ген можно клонировать с использованием той же стратегии во многие векторы, которые были разработаны, чтобы помочь выяснить функцию гена.
МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
Конструирование плазмиды
Для создания генных конструкций использовали стандартные методы клонирования генов (Sambrook and Russell, 2001).Подробное описание того, как были построены векторы, можно найти в онлайн-версии этой статьи в разделе дополнительных данных на http://www.plantphysiol.org.
Растительные материалы, условия роста и трансформация растений
Растения Arabidopsis Landsberg erecta использовали для трансформации растений методом окунания цветов (Clough and Bent, 1998). Растения выращивали при постоянном белом свете при 22 ° C на агаре Мурашиге и Скуга (1 × соли Мурашиге и Скуга, 3% [мас. / Об.] Suc и 0.8% [мас. / Об.] Агар). Подробное описание методов, используемых в экспериментах, можно найти в онлайн-версии этой статьи в разделе дополнительных данных на сайте http://www.plantphysiol.org.
Праймеры AttB, ПЦР и реакция рекомбинации для введения последовательностей в pDONR207
Праймеры
с последовательностями attB1 и attB2 были приобретены у Invitrogen. ПЦР и реакции рекомбинации клоназы ВР in vitro проводили в соответствии с инструкциями производителя (Invitrogen).Продукт реакций рекомбинации (реакции БП) использовали для трансформации компетентного Escherichia coli , штамм DH5α с помощью теплового шока.
Реакции рекомбинации для введения последовательностей в целевые векторы
Реакции LR-клоназы для переноса фрагментов ДНК из исходных клонов в целевые векторы проводили в соответствии с инструкциями производителя (Invitrogen). Продукт реакций рекомбинации (реакции LR) использовали для трансформации компетентного E . coli штамм DH5α с использованием теплового шока.
Благодарности
Мы благодарим Нам-Хай Чуа (Университет Рокфеллера, Нью-Йорк) за любезно предоставленный вектор PER8, Центр применения молекулярной биологии в международном сельском хозяйстве для векторов pCambia, Дэвида Джексона (Лаборатория Колд-Спринг-Харбор, Колд-Спринг) Harbor, NY) для плазмиды pSKp-mgfp6 и Thomas Laux (Университет Фрайбурга, Германия) для плазмиды A1-A. Мы благодарим Валерию Гальярдини, Яну Шнайдер и Бриджит Габатулер за помощь с секвенированием и Питера Копфа за техническую помощь.Мы также благодарим Риту Гросс-Хардт и Сиана Кертиса за критическое прочтение рукописи и Жан-Жака Питте за его квалифицированную помощь в обработке изображений, содержащихся в дополнительных данных.
Ссылки
Arabidopsis Genome Initiative (2000) Анализ последовательности генома цветкового растения Arabidopsis thaliana . Nature 408 : 796-815 [PubMed] [Google Scholar]
Batni S, Scalzetti L, Moody SA, Knox BE (1996) Характеристика гена родопсина Xenopus .J Biol Chem 271 : 3179-3186 [PubMed] [Google Scholar]
Bechtold N, Ellis J, Pelletier G (1993) In planta Agrobacterium опосредовала перенос генов путем инфильтрации взрослых Arabidopsis thaliana растений. CR Acad Sci Paris Life Sci 316 : 1194-1199 [Google Scholar]
Böhner S, Lenk I, Rieping M, Herold M, Gatz C (1999) Активатор транскрипции TGV опосредует индуцируемый дексаметазоном и неактивный татрациклин ген выражение.Plant J 19 : 87-95 [PubMed] [Google Scholar]
Bruce W., Folkerts O, Garnaat C, Crasta O, Roth B, Bowen B (2000) Профилирование экспрессии генов пути флаваноидов кукурузы, контролируемых индуцируемые эстродиолом факторы транскрипции CRC и P. Plant Cell 12 : 65-80 [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
Clough SJ, Bent AF (1998) Цветочный дип: упрощенный метод для Argobacterium -опосредованная трансформация Arabidopsis thaliana 16 : 735-743 [PubMed] [Google Scholar]
Curtis MD, Rae AL, Rusu AG, Harrison SJ, Manners JM (1997) Промотор гена пероксидазы, индуцированный фитопатогенами и метилжасмонатом трансгенных растений.Mol Plant-Microbe Interact 10 : 326-338 [PubMed] [Google Scholar]
Gatz C, Frohberg C, Wendenburg R (1992) Строгая репрессия и гомогенная депрессия тетрациклином модифицированного промотора CaMV35S в интактном трансгенном табачные растения. Plant J 2 : 397-404 [PubMed] [Google Scholar]
Gawantka V, Pollet N, Delius H, Vingron M, Pfister R, Nitsch R, Blumenstock C, Niehrs C (1998) Скрининг экспрессии генов в Xenopus идентифицирует молекулярные пути, предсказывает функцию генов и обеспечивает глобальную картину формирования эмбрионального паттерна. Mech Dev 77 : 95-141 [PubMed] [Google Scholar]
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2000) Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro. Genome Res 10 : 1788-1795 [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
Holtorf S, Apel K, Bohlmann H (1995) Сравнение различных конститутивных и индуцибельных промоторов для сверхэкспрессии трансгенов в Arabidopsis thaliana . Plant Mol Biol 29 : 637-646 [PubMed] [Google Scholar]
Jefferson RA, Kavanagh TA, Bevan MW (1987) Слияние GUS: β-глюкуронидаза как чувствительный и универсальный маркер слияния генов у высших растений.EMBO J 6 : 3901-3907 [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
Карими М., Инзе Д., Депикер А (2002) векторы GATEWAY для трансформации растений, опосредованной Agrobacterium . Trends Plant Sci 7 : 193-195 [PubMed] [Google Scholar]
Мартинез А. , Спаркс С., Харт С.А., Томпсон Дж., Джепсон I (1999) Транскрипция, индуцируемая агонистом экдизона в трансгенных растениях табака. Plant J 19 : 97-106 [PubMed] [Google Scholar]
Mayer KF (1998) Klonierung und Expressionsanalyse des Meristemgens WUSCHEL ( WUS ) от Arabidopsis thaliana .Кандидатская диссертация. Universität Tübingen, Tübingen, Germany
Mayer KF, Schoof H, Haecker A, Lenhard M, Jürgens G, Laux T (1998) Роль WUSCHEL в регулировании судьбы стволовых клеток в меристеме побегов Arabidopsis . Cell 95 : 805-815 [PubMed] [Google Scholar]
Odell JT, Nagy F, Chua NH (1985) Идентификация последовательностей ДНК, необходимых для активности промотора 35S вируса мозаики цветной капусты. Nature 3: 13 : 810-812 [PubMed] [Google Scholar]
Sambrook J, Russell D (2001) Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Ed 3. Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, NY
Schaffer R, Ramsay N, Samach A, Corden S, Putterill J, Carre IA, Coupland G (1999). Мутация в позднем удлиненном гипокотиле арабидопсиса нарушает циркадные ритмы и фотопериодический контроль цветения. Cell 93 : 1219-1229 [PubMed] [Google Scholar]
Tissier AF, Marillonnet S, Klimyuk V, Patel K, Torres MA, Murphy G, Jones JD (1999) Множественные независимые дефектные вставки транспозонов супрессоров-мутаторов в Arabidopsis: инструмент функциональной геномики.Plant Cell 11 : 1841-1852 [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
Varagona MJ, Schmidt RJ, Raikhel NV (1992) Сигнал (ы) ядерной локализации, необходимый для ядерного нацеливания регуляторных органов кукурузы протеин непрозрачный-2. Plant Cell 10 : 1213-1227 [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
von Arnim AG, Osterlund MT, Kwok SF, Deng XW (1997) Генетический и онтогенетический контроль ядерной аккумуляции COP1, репрессор фотоморфогенеза Arabidopsis . Plant Physiol 114 : 779-788 [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
Weinmann P, Gossen M, Hillen W., Bujard H, Gatz C (1994) Химерный трансактиватор позволяет генам, чувствительным к тетрациклину экспрессия в целых растениях. Plant J 5 : 559-569 [PubMed] [Google Scholar]
Wilson K, Long D, Swinburne J, Coupland G (1996) Вставка диссоциации A вызывает полудоминантную мутацию, которая увеличивает экспрессию TINY , ген Arabidopsis, родственный APETALA2 .Plant Cell 8 : 659-671 [статья без PMC] [PubMed] [Google Scholar]
Zuo J, Niu QW, Chau NH (2000) Трансактиватор на основе рецептора эстрогена XVE опосредует высокоиндуцируемую экспрессию генов в растениях . Plant J 24 : 265-273 [PubMed] [Google Scholar]
Zuo J, Niu QW, Frugis G, Chau NH (2002) Ген WUSCHEL способствует переходу от вегетативного к эмбриональному у Arabidopsis . Plant J 30 : 349-359 [PubMed] [Google Scholar]
Clojure — структуры данных
Все коллекции Clojure неизменны и постоянны.В частности, коллекции Clojure поддерживают эффективное создание «модифицированных» версий за счет использования структурного разделения и обеспечивают постоянное использование всех своих гарантий производительности с привязкой к производительности. Коллекции эффективны и изначально ориентированы на многопотоковое исполнение. Коллекции представлены абстракциями, и может быть одна или несколько конкретных реализаций. В частности, поскольку операции «модификации» приводят к появлению новых коллекций, новая коллекция может не иметь того же конкретного типа, что и исходная коллекция, но будет иметь тот же логический (интерфейсный) тип.
Все коллекции поддерживают счетчик для получения размера коллекции, конъюнктуру для «добавления» в коллекцию и seq для получения последовательности, которая может обходить всю коллекцию, хотя их конкретное поведение немного отличается для разных типов коллекций.
Поскольку коллекции поддерживают функцию seq, все функции последовательности могут использоваться с любой коллекцией.
Хэши коллекции Java
Интерфейсы коллекции Java определяют алгоритмы для списков, наборов и карт при вычислении значений hashCode ().Все коллекции Clojure соответствуют этим спецификациям в своих реализациях hashCode ().
Хэши коллекции Clojure
Clojure предоставляет собственные вычисления хеширования, которые обеспечивают лучшие свойства хеширования для коллекций (и других типов), известные как значение hasheq .
Интерфейс IHashEq отмечает коллекции, которые предоставляют функцию hasheq () для получения значения hasheq. В Clojure хеш-функцию можно использовать для вычисления значения hasheq.
Упорядоченные коллекции (вектор, список, последовательность и т. Д.) Должны использовать следующий алгоритм для вычисления hasheq (где hash вычисляет hasheq). Обратите внимание, что unchecked-add-int и unchecked-multiply-int используются для вычисления целочисленного переполнения.
(defn с упорядочением по хешу [коллекция] (-> (уменьшить (fn [acc e] (unchecked-add-int (unchecked-multiply-int 31 согласно) (Неужели он))) 1 коллекция) (mix-collection-hash (подсчет коллекции))))
Неупорядоченные коллекции (карты, наборы) должны использовать следующий алгоритм для вычисления hasheq.Запись на карте рассматривается как упорядоченный набор ключей и значений. Обратите внимание, что unchecked-add-int используется для вычисления целочисленного переполнения.
(defn hash-unordered [collection] (-> (уменьшить unchecked-add-int 0 (коллекция хэшей карты)) (mix-collection-hash (подсчет коллекции))))
Определение векторного пространства
MATH 240: Определение векторного пространства
MATH 240: векторные пространства
определение: Векторное пространство — множество V, на котором определены две операции + и · , называется сложением вектора , и скалярным умножением .
Операция + (сложение векторов) должна удовлетворять следующим условиям:
закрытие: Если u и v — любые векторы из V, то сумма u + v принадлежит В.
(1) Коммутативный закон: Для всех векторов u и v в V, u + v = v + u
(2) Ассоциативный закон: Для всех векторов u , v , w in V, u + ( v + w ) = ( u + v ) + w
(3) Идентификационный номер присадки: Набор V содержит элемент аддитивной идентичности , обозначается 0 , такой, что для любого вектора v в V, 0 + v = v а также v + 0 = v .
(4) Обратные добавки: Для каждого вектора v в V уравнения v + x = 0 а также x + v = 0 есть решение x в V, называется добавкой , инверсией против , и обозначается — v .
Операция · (скалярное умножение) определяется между действительными числами (или скалярами) и векторами, и должен удовлетворять следующим условиям:
закрытие: Если v в любом векторе в V, а c — любое действительное число, тогда произведение c · v принадлежит В.
(5) Распределительное право: Для всех действительных чисел c и всех векторов u , v в V, c · ( u + v ) = c · u + c · v
(6) Распределительное право : Для всех действительных чисел c, d и всех векторов v в V, (c + d) · v = c · v + d · v
(7) Ассоциативный закон : Для всех действительных чисел c, d и всех векторов v в V, с · (d · v ) = (cd) · v
(8) Унитарный закон : Для всех векторов v в V, 1 · против = против
Подпространства определение: Пусть V — векторное пространство, а W — подмножество V.